Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TDRD12Q587J7 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TDRD12Q587J7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
TDRD12Q587J7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TDRD12Q587J7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TDRD12Q587J7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TDRD12Q587J7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TDRD12Q587J7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TDRD12Q587J7 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TDRD12Q587J7 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TDRD12Q587J7 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TDRD12Q587J7 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TDRD12Q587J7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TDRD12Q587J7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TDRD12Q587J7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TDRD12Q587J7 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TDRD12Q587J7 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TDRD12Q587J7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TDRD12Q587J7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TDRD12Q587J7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
TDRD12Q587J7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TDRD12Q587J7 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TDRD12Q587J7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TDRD12Q587J7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TDRD12Q587J7 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TDRD12Q587J7 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TDRD12Q587J7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TDRD12Q587J7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TDRD12Q587J7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TDRD12Q587J7 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TDRD12Q587J7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TDRD12Q587J7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TDRD12Q587J7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TDRD12Q587J7 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TDRD12Q587J7 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
TDRD12Q587J7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TDRD12Q587J7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TDRD12Q587J7 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TDRD12Q587J7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TDRD12Q587J7 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TDRD12Q587J7 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TDRD12Q587J7 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TDRD12Q587J7 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TDRD12Q587J7 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TDRD12Q587J7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TDRD12Q587J7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TDRD12Q587J7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TDRD12Q587J7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TDRD12Q587J7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TDRD12Q587J7 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TDRD12Q587J7 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TDRD12Q587J7 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TDRD12Q587J7 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TDRD12Q587J7 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
TDRD12Q587J7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TDRD12Q587J7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TDRD12Q587J7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TDRD12Q587J7 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TDRD12Q587J7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TDRD12Q587J7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TDRD12Q587J7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TDRD12Q587J7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TDRD12Q587J7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TDRD12Q587J7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TDRD12Q587J7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TDRD12Q587J7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TDRD12Q587J7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TDRD12Q587J7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TDRD12Q587J7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TDRD12Q587J7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TDRD12Q587J7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TDRD12Q587J7 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TDRD12Q587J7 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TDRD12Q587J7 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TDRD12Q587J7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TDRD12Q587J7 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
TDRD12Q587J7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TDRD12Q587J7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TDRD12Q587J7 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TDRD12Q587J7 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TDRD12Q587J7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TDRD12Q587J7 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TDRD12Q587J7 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TDRD12Q587J7 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TDRD12Q587J7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
TDRD12Q587J7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TDRD12Q587J7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TDRD12Q587J7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TDRD12Q587J7 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TDRD12Q587J7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TDRD12Q587J7 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TDRD12Q587J7 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TDRD12Q587J7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TDRD12Q587J7 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TDRD12Q587J7 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TDRD12Q587J7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TDRD12Q587J7 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TDRD12Q587J7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
TDRD12Q587J7 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TDRD12Q587J7 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms