Protein–RNA interactions for Protein: Q53SF7

COBLL1, Cordon-bleu protein-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COBLL1Q53SF7 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
COBLL1Q53SF7 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
COBLL1Q53SF7 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
COBLL1Q53SF7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
COBLL1Q53SF7 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
COBLL1Q53SF7 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
COBLL1Q53SF7 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
COBLL1Q53SF7 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
COBLL1Q53SF7 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
COBLL1Q53SF7 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
COBLL1Q53SF7 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
COBLL1Q53SF7 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
COBLL1Q53SF7 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
COBLL1Q53SF7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
COBLL1Q53SF7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
COBLL1Q53SF7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
COBLL1Q53SF7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
COBLL1Q53SF7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
COBLL1Q53SF7 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
COBLL1Q53SF7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
COBLL1Q53SF7 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
COBLL1Q53SF7 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
COBLL1Q53SF7 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
COBLL1Q53SF7 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
COBLL1Q53SF7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
COBLL1Q53SF7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
COBLL1Q53SF7 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
COBLL1Q53SF7 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
COBLL1Q53SF7 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
COBLL1Q53SF7 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
COBLL1Q53SF7 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
COBLL1Q53SF7 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
COBLL1Q53SF7 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
COBLL1Q53SF7 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
COBLL1Q53SF7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
COBLL1Q53SF7 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
COBLL1Q53SF7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
COBLL1Q53SF7 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
COBLL1Q53SF7 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
COBLL1Q53SF7 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
COBLL1Q53SF7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
COBLL1Q53SF7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
COBLL1Q53SF7 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
COBLL1Q53SF7 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
COBLL1Q53SF7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
COBLL1Q53SF7 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
COBLL1Q53SF7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
COBLL1Q53SF7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
COBLL1Q53SF7 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
COBLL1Q53SF7 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
COBLL1Q53SF7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
COBLL1Q53SF7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
COBLL1Q53SF7 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
COBLL1Q53SF7 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
COBLL1Q53SF7 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
COBLL1Q53SF7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
COBLL1Q53SF7 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
COBLL1Q53SF7 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
COBLL1Q53SF7 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
COBLL1Q53SF7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
COBLL1Q53SF7 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
COBLL1Q53SF7 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
COBLL1Q53SF7 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
COBLL1Q53SF7 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
COBLL1Q53SF7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
COBLL1Q53SF7 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
COBLL1Q53SF7 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
COBLL1Q53SF7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
COBLL1Q53SF7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
COBLL1Q53SF7 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
COBLL1Q53SF7 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
COBLL1Q53SF7 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
COBLL1Q53SF7 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
COBLL1Q53SF7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
COBLL1Q53SF7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
COBLL1Q53SF7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
COBLL1Q53SF7 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
COBLL1Q53SF7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
COBLL1Q53SF7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
COBLL1Q53SF7 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
COBLL1Q53SF7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
COBLL1Q53SF7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
COBLL1Q53SF7 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
COBLL1Q53SF7 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
COBLL1Q53SF7 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
COBLL1Q53SF7 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
COBLL1Q53SF7 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
COBLL1Q53SF7 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
COBLL1Q53SF7 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
COBLL1Q53SF7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
COBLL1Q53SF7 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
COBLL1Q53SF7 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
COBLL1Q53SF7 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
COBLL1Q53SF7 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
COBLL1Q53SF7 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
COBLL1Q53SF7 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
COBLL1Q53SF7 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
COBLL1Q53SF7 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
COBLL1Q53SF7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
COBLL1Q53SF7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms