Protein–RNA interactions for Protein: Q53EL6

PDCD4, Programmed cell death protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD4Q53EL6 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDCD4Q53EL6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDCD4Q53EL6 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDCD4Q53EL6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDCD4Q53EL6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDCD4Q53EL6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDCD4Q53EL6 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDCD4Q53EL6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDCD4Q53EL6 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDCD4Q53EL6 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDCD4Q53EL6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDCD4Q53EL6 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDCD4Q53EL6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDCD4Q53EL6 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDCD4Q53EL6 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDCD4Q53EL6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDCD4Q53EL6 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDCD4Q53EL6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDCD4Q53EL6 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDCD4Q53EL6 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDCD4Q53EL6 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDCD4Q53EL6 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDCD4Q53EL6 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PDCD4Q53EL6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDCD4Q53EL6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDCD4Q53EL6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDCD4Q53EL6 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDCD4Q53EL6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PDCD4Q53EL6 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDCD4Q53EL6 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PDCD4Q53EL6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDCD4Q53EL6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDCD4Q53EL6 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDCD4Q53EL6 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDCD4Q53EL6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDCD4Q53EL6 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDCD4Q53EL6 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDCD4Q53EL6 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDCD4Q53EL6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDCD4Q53EL6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDCD4Q53EL6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDCD4Q53EL6 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDCD4Q53EL6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDCD4Q53EL6 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDCD4Q53EL6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDCD4Q53EL6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDCD4Q53EL6 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDCD4Q53EL6 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PDCD4Q53EL6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDCD4Q53EL6 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDCD4Q53EL6 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDCD4Q53EL6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDCD4Q53EL6 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PDCD4Q53EL6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PDCD4Q53EL6 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDCD4Q53EL6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDCD4Q53EL6 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDCD4Q53EL6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDCD4Q53EL6 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDCD4Q53EL6 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDCD4Q53EL6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDCD4Q53EL6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDCD4Q53EL6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDCD4Q53EL6 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDCD4Q53EL6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDCD4Q53EL6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDCD4Q53EL6 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDCD4Q53EL6 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDCD4Q53EL6 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDCD4Q53EL6 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDCD4Q53EL6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDCD4Q53EL6 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDCD4Q53EL6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDCD4Q53EL6 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDCD4Q53EL6 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDCD4Q53EL6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDCD4Q53EL6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDCD4Q53EL6 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDCD4Q53EL6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDCD4Q53EL6 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDCD4Q53EL6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDCD4Q53EL6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDCD4Q53EL6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDCD4Q53EL6 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDCD4Q53EL6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDCD4Q53EL6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDCD4Q53EL6 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDCD4Q53EL6 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDCD4Q53EL6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDCD4Q53EL6 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDCD4Q53EL6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDCD4Q53EL6 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDCD4Q53EL6 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PDCD4Q53EL6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
PDCD4Q53EL6 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDCD4Q53EL6 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDCD4Q53EL6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDCD4Q53EL6 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDCD4Q53EL6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDCD4Q53EL6 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 309.3 ms