Protein–RNA interactions for Protein: Q52LC2

ATP6AP1L, V-type proton ATPase subunit S1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1LQ52LC2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATP6AP1LQ52LC2 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ATP6AP1LQ52LC2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
ATP6AP1LQ52LC2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
ATP6AP1LQ52LC2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP6AP1LQ52LC2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP6AP1LQ52LC2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP6AP1LQ52LC2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP6AP1LQ52LC2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP6AP1LQ52LC2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP6AP1LQ52LC2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP6AP1LQ52LC2 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP6AP1LQ52LC2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP6AP1LQ52LC2 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP6AP1LQ52LC2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP6AP1LQ52LC2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP6AP1LQ52LC2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP6AP1LQ52LC2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP6AP1LQ52LC2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP6AP1LQ52LC2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP6AP1LQ52LC2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP6AP1LQ52LC2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP6AP1LQ52LC2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP6AP1LQ52LC2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP6AP1LQ52LC2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP6AP1LQ52LC2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP6AP1LQ52LC2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP6AP1LQ52LC2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP6AP1LQ52LC2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP6AP1LQ52LC2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP6AP1LQ52LC2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP6AP1LQ52LC2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP6AP1LQ52LC2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP6AP1LQ52LC2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP6AP1LQ52LC2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP6AP1LQ52LC2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP6AP1LQ52LC2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP6AP1LQ52LC2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP6AP1LQ52LC2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP6AP1LQ52LC2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP6AP1LQ52LC2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP6AP1LQ52LC2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP6AP1LQ52LC2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP6AP1LQ52LC2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP6AP1LQ52LC2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP6AP1LQ52LC2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP6AP1LQ52LC2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP6AP1LQ52LC2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP6AP1LQ52LC2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP6AP1LQ52LC2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP6AP1LQ52LC2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP6AP1LQ52LC2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP6AP1LQ52LC2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP6AP1LQ52LC2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP6AP1LQ52LC2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP6AP1LQ52LC2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP6AP1LQ52LC2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP6AP1LQ52LC2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP6AP1LQ52LC2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP6AP1LQ52LC2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP6AP1LQ52LC2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP6AP1LQ52LC2 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP6AP1LQ52LC2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP6AP1LQ52LC2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP6AP1LQ52LC2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP6AP1LQ52LC2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP6AP1LQ52LC2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP6AP1LQ52LC2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP6AP1LQ52LC2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP6AP1LQ52LC2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP6AP1LQ52LC2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP6AP1LQ52LC2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP6AP1LQ52LC2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP6AP1LQ52LC2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP6AP1LQ52LC2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP6AP1LQ52LC2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP6AP1LQ52LC2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP6AP1LQ52LC2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP6AP1LQ52LC2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP6AP1LQ52LC2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATP6AP1LQ52LC2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATP6AP1LQ52LC2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATP6AP1LQ52LC2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATP6AP1LQ52LC2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP6AP1LQ52LC2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP6AP1LQ52LC2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP6AP1LQ52LC2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP6AP1LQ52LC2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP6AP1LQ52LC2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP6AP1LQ52LC2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP6AP1LQ52LC2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP6AP1LQ52LC2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP6AP1LQ52LC2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP6AP1LQ52LC2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP6AP1LQ52LC2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP6AP1LQ52LC2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP6AP1LQ52LC2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP6AP1LQ52LC2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP6AP1LQ52LC2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP6AP1LQ52LC2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms