Protein–RNA interactions for Protein: Q2V2M9

FHOD3, FH1/FH2 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHOD3Q2V2M9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
FHOD3Q2V2M9 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
FHOD3Q2V2M9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
FHOD3Q2V2M9 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.3■■■■□ 3.72
FHOD3Q2V2M9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
FHOD3Q2V2M9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
FHOD3Q2V2M9 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.3■■■■□ 3.72
FHOD3Q2V2M9 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC38.3■■■■□ 3.72
FHOD3Q2V2M9 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC38.3■■■■□ 3.72
FHOD3Q2V2M9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC38.3■■■■□ 3.72
FHOD3Q2V2M9 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC38.29■■■■□ 3.72
FHOD3Q2V2M9 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
FHOD3Q2V2M9 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
FHOD3Q2V2M9 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
FHOD3Q2V2M9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
FHOD3Q2V2M9 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
FHOD3Q2V2M9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC38.28■■■■□ 3.72
FHOD3Q2V2M9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
FHOD3Q2V2M9 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
FHOD3Q2V2M9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
FHOD3Q2V2M9 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
FHOD3Q2V2M9 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC38.27■■■■□ 3.72
FHOD3Q2V2M9 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC38.27■■■■□ 3.72
FHOD3Q2V2M9 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC38.27■■■■□ 3.72
FHOD3Q2V2M9 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC38.27■■■■□ 3.72
FHOD3Q2V2M9 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
FHOD3Q2V2M9 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
FHOD3Q2V2M9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.26■■■■□ 3.72
FHOD3Q2V2M9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.26■■■■□ 3.72
FHOD3Q2V2M9 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
FHOD3Q2V2M9 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
FHOD3Q2V2M9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC38.25■■■■□ 3.71
FHOD3Q2V2M9 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
FHOD3Q2V2M9 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC38.25■■■■□ 3.71
FHOD3Q2V2M9 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC38.25■■■■□ 3.71
FHOD3Q2V2M9 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC38.25■■■■□ 3.71
FHOD3Q2V2M9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC38.25■■■■□ 3.71
FHOD3Q2V2M9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
FHOD3Q2V2M9 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC38.24■■■■□ 3.71
FHOD3Q2V2M9 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC38.24■■■■□ 3.71
FHOD3Q2V2M9 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
FHOD3Q2V2M9 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC38.23■■■■□ 3.71
FHOD3Q2V2M9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
FHOD3Q2V2M9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
FHOD3Q2V2M9 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC38.21■■■■□ 3.71
FHOD3Q2V2M9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
FHOD3Q2V2M9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC38.21■■■■□ 3.71
FHOD3Q2V2M9 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC38.2■■■■□ 3.71
FHOD3Q2V2M9 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC38.2■■■■□ 3.71
FHOD3Q2V2M9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
FHOD3Q2V2M9 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC38.18■■■■□ 3.7
FHOD3Q2V2M9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
FHOD3Q2V2M9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
FHOD3Q2V2M9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
FHOD3Q2V2M9 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC38.17■■■■□ 3.7
FHOD3Q2V2M9 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.17■■■■□ 3.7
FHOD3Q2V2M9 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC38.17■■■■□ 3.7
FHOD3Q2V2M9 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC38.17■■■■□ 3.7
FHOD3Q2V2M9 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC38.17■■■■□ 3.7
FHOD3Q2V2M9 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.17■■■■□ 3.7
FHOD3Q2V2M9 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
FHOD3Q2V2M9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
FHOD3Q2V2M9 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.16■■■■□ 3.7
FHOD3Q2V2M9 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
FHOD3Q2V2M9 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
FHOD3Q2V2M9 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC38.15■■■■□ 3.7
FHOD3Q2V2M9 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC38.15■■■■□ 3.7
FHOD3Q2V2M9 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC38.15■■■■□ 3.7
FHOD3Q2V2M9 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
FHOD3Q2V2M9 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC38.15■■■■□ 3.7
FHOD3Q2V2M9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
FHOD3Q2V2M9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
FHOD3Q2V2M9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC38.13■■■■□ 3.69
FHOD3Q2V2M9 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
FHOD3Q2V2M9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC38.13■■■■□ 3.69
FHOD3Q2V2M9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
FHOD3Q2V2M9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
FHOD3Q2V2M9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
FHOD3Q2V2M9 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC38.12■■■■□ 3.69
FHOD3Q2V2M9 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC38.12■■■■□ 3.69
FHOD3Q2V2M9 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
FHOD3Q2V2M9 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
FHOD3Q2V2M9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
FHOD3Q2V2M9 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC38.11■■■■□ 3.69
FHOD3Q2V2M9 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC38.11■■■■□ 3.69
FHOD3Q2V2M9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC38.11■■■■□ 3.69
FHOD3Q2V2M9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
FHOD3Q2V2M9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC38.11■■■■□ 3.69
FHOD3Q2V2M9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC38.1■■■■□ 3.69
FHOD3Q2V2M9 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC38.1■■■■□ 3.69
FHOD3Q2V2M9 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.1■■■■□ 3.69
FHOD3Q2V2M9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.09■■■■□ 3.69
FHOD3Q2V2M9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
FHOD3Q2V2M9 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
FHOD3Q2V2M9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.09■■■■□ 3.69
FHOD3Q2V2M9 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
FHOD3Q2V2M9 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC38.08■■■■□ 3.69
FHOD3Q2V2M9 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC38.08■■■■□ 3.69
FHOD3Q2V2M9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
FHOD3Q2V2M9 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC38.08■■■■□ 3.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.1 ms