Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KLHL40Q2TBA0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KLHL40Q2TBA0 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KLHL40Q2TBA0 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KLHL40Q2TBA0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KLHL40Q2TBA0 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KLHL40Q2TBA0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
KLHL40Q2TBA0 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
KLHL40Q2TBA0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
KLHL40Q2TBA0 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
KLHL40Q2TBA0 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
KLHL40Q2TBA0 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KLHL40Q2TBA0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KLHL40Q2TBA0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KLHL40Q2TBA0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KLHL40Q2TBA0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
KLHL40Q2TBA0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
KLHL40Q2TBA0 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KLHL40Q2TBA0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
KLHL40Q2TBA0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KLHL40Q2TBA0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KLHL40Q2TBA0 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
KLHL40Q2TBA0 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
KLHL40Q2TBA0 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
KLHL40Q2TBA0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
KLHL40Q2TBA0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KLHL40Q2TBA0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KLHL40Q2TBA0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KLHL40Q2TBA0 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KLHL40Q2TBA0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KLHL40Q2TBA0 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KLHL40Q2TBA0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KLHL40Q2TBA0 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
KLHL40Q2TBA0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
KLHL40Q2TBA0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
KLHL40Q2TBA0 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
KLHL40Q2TBA0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KLHL40Q2TBA0 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KLHL40Q2TBA0 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KLHL40Q2TBA0 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KLHL40Q2TBA0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KLHL40Q2TBA0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KLHL40Q2TBA0 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
KLHL40Q2TBA0 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KLHL40Q2TBA0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KLHL40Q2TBA0 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KLHL40Q2TBA0 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KLHL40Q2TBA0 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KLHL40Q2TBA0 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KLHL40Q2TBA0 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KLHL40Q2TBA0 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KLHL40Q2TBA0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KLHL40Q2TBA0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
KLHL40Q2TBA0 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
KLHL40Q2TBA0 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KLHL40Q2TBA0 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KLHL40Q2TBA0 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
KLHL40Q2TBA0 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
KLHL40Q2TBA0 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
KLHL40Q2TBA0 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
KLHL40Q2TBA0 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
KLHL40Q2TBA0 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KLHL40Q2TBA0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
KLHL40Q2TBA0 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KLHL40Q2TBA0 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KLHL40Q2TBA0 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
KLHL40Q2TBA0 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
KLHL40Q2TBA0 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
KLHL40Q2TBA0 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
KLHL40Q2TBA0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
KLHL40Q2TBA0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
KLHL40Q2TBA0 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
KLHL40Q2TBA0 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
KLHL40Q2TBA0 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
KLHL40Q2TBA0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KLHL40Q2TBA0 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KLHL40Q2TBA0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
KLHL40Q2TBA0 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KLHL40Q2TBA0 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KLHL40Q2TBA0 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KLHL40Q2TBA0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KLHL40Q2TBA0 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
KLHL40Q2TBA0 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
KLHL40Q2TBA0 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
KLHL40Q2TBA0 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
KLHL40Q2TBA0 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
KLHL40Q2TBA0 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
KLHL40Q2TBA0 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
KLHL40Q2TBA0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
KLHL40Q2TBA0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
KLHL40Q2TBA0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
KLHL40Q2TBA0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
KLHL40Q2TBA0 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
KLHL40Q2TBA0 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
KLHL40Q2TBA0 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
KLHL40Q2TBA0 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
KLHL40Q2TBA0 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
KLHL40Q2TBA0 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
KLHL40Q2TBA0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
KLHL40Q2TBA0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms