Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2I5

KRT24, Keratin, type I cytoskeletal 24, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT24Q2M2I5 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
KRT24Q2M2I5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
KRT24Q2M2I5 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
KRT24Q2M2I5 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
KRT24Q2M2I5 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
KRT24Q2M2I5 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
KRT24Q2M2I5 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
KRT24Q2M2I5 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
KRT24Q2M2I5 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
KRT24Q2M2I5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
KRT24Q2M2I5 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
KRT24Q2M2I5 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
KRT24Q2M2I5 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
KRT24Q2M2I5 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
KRT24Q2M2I5 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
KRT24Q2M2I5 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
KRT24Q2M2I5 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
KRT24Q2M2I5 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
KRT24Q2M2I5 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
KRT24Q2M2I5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
KRT24Q2M2I5 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
KRT24Q2M2I5 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
KRT24Q2M2I5 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
KRT24Q2M2I5 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
KRT24Q2M2I5 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
KRT24Q2M2I5 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
KRT24Q2M2I5 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
KRT24Q2M2I5 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
KRT24Q2M2I5 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
KRT24Q2M2I5 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
KRT24Q2M2I5 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
KRT24Q2M2I5 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
KRT24Q2M2I5 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
KRT24Q2M2I5 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
KRT24Q2M2I5 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
KRT24Q2M2I5 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
KRT24Q2M2I5 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
KRT24Q2M2I5 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
KRT24Q2M2I5 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
KRT24Q2M2I5 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
KRT24Q2M2I5 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
KRT24Q2M2I5 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
KRT24Q2M2I5 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
KRT24Q2M2I5 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
KRT24Q2M2I5 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
KRT24Q2M2I5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
KRT24Q2M2I5 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
KRT24Q2M2I5 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
KRT24Q2M2I5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
KRT24Q2M2I5 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
KRT24Q2M2I5 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
KRT24Q2M2I5 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
KRT24Q2M2I5 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
KRT24Q2M2I5 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
KRT24Q2M2I5 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
KRT24Q2M2I5 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
KRT24Q2M2I5 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
KRT24Q2M2I5 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC30.86■■■□□ 2.53
KRT24Q2M2I5 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
KRT24Q2M2I5 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
KRT24Q2M2I5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
KRT24Q2M2I5 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
KRT24Q2M2I5 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
KRT24Q2M2I5 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
KRT24Q2M2I5 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
KRT24Q2M2I5 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
KRT24Q2M2I5 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
KRT24Q2M2I5 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
KRT24Q2M2I5 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
KRT24Q2M2I5 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
KRT24Q2M2I5 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
KRT24Q2M2I5 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
KRT24Q2M2I5 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
KRT24Q2M2I5 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
KRT24Q2M2I5 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
KRT24Q2M2I5 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC30.83■■■□□ 2.53
KRT24Q2M2I5 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
KRT24Q2M2I5 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
KRT24Q2M2I5 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
KRT24Q2M2I5 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
KRT24Q2M2I5 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
KRT24Q2M2I5 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
KRT24Q2M2I5 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC30.82■■■□□ 2.52
KRT24Q2M2I5 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC30.82■■■□□ 2.52
KRT24Q2M2I5 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
KRT24Q2M2I5 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
KRT24Q2M2I5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
KRT24Q2M2I5 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
KRT24Q2M2I5 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
KRT24Q2M2I5 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
KRT24Q2M2I5 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
KRT24Q2M2I5 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
KRT24Q2M2I5 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
KRT24Q2M2I5 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
KRT24Q2M2I5 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
KRT24Q2M2I5 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
KRT24Q2M2I5 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
KRT24Q2M2I5 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
KRT24Q2M2I5 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
KRT24Q2M2I5 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.3 ms