Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

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Length 1,714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
COL24A1Q17RW2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
COL24A1Q17RW2 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
COL24A1Q17RW2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
COL24A1Q17RW2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
COL24A1Q17RW2 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
COL24A1Q17RW2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
COL24A1Q17RW2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
COL24A1Q17RW2 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
COL24A1Q17RW2 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
COL24A1Q17RW2 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
COL24A1Q17RW2 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
COL24A1Q17RW2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
COL24A1Q17RW2 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
COL24A1Q17RW2 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
COL24A1Q17RW2 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
COL24A1Q17RW2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
COL24A1Q17RW2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
COL24A1Q17RW2 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
COL24A1Q17RW2 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC30.7■■■□□ 2.51
COL24A1Q17RW2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
COL24A1Q17RW2 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.5
COL24A1Q17RW2 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.5
COL24A1Q17RW2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC30.7■■■□□ 2.5
COL24A1Q17RW2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
COL24A1Q17RW2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
COL24A1Q17RW2 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
COL24A1Q17RW2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
COL24A1Q17RW2 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
COL24A1Q17RW2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
COL24A1Q17RW2 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC30.67■■■□□ 2.5
COL24A1Q17RW2 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
COL24A1Q17RW2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
COL24A1Q17RW2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
COL24A1Q17RW2 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
COL24A1Q17RW2 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
COL24A1Q17RW2 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
COL24A1Q17RW2 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
COL24A1Q17RW2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
COL24A1Q17RW2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
COL24A1Q17RW2 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC30.63■■■□□ 2.49
COL24A1Q17RW2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
COL24A1Q17RW2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
COL24A1Q17RW2 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
COL24A1Q17RW2 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
COL24A1Q17RW2 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
COL24A1Q17RW2 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
COL24A1Q17RW2 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
COL24A1Q17RW2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
COL24A1Q17RW2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
COL24A1Q17RW2 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
COL24A1Q17RW2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
COL24A1Q17RW2 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
COL24A1Q17RW2 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
COL24A1Q17RW2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
COL24A1Q17RW2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
COL24A1Q17RW2 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
COL24A1Q17RW2 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
COL24A1Q17RW2 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
COL24A1Q17RW2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
COL24A1Q17RW2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
COL24A1Q17RW2 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
COL24A1Q17RW2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
COL24A1Q17RW2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
COL24A1Q17RW2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
COL24A1Q17RW2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
COL24A1Q17RW2 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
COL24A1Q17RW2 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
COL24A1Q17RW2 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
COL24A1Q17RW2 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
COL24A1Q17RW2 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
COL24A1Q17RW2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
COL24A1Q17RW2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
COL24A1Q17RW2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
COL24A1Q17RW2 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
COL24A1Q17RW2 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
COL24A1Q17RW2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
COL24A1Q17RW2 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
COL24A1Q17RW2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
COL24A1Q17RW2 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
COL24A1Q17RW2 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
COL24A1Q17RW2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
COL24A1Q17RW2 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
COL24A1Q17RW2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
COL24A1Q17RW2 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
COL24A1Q17RW2 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
COL24A1Q17RW2 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
COL24A1Q17RW2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
COL24A1Q17RW2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
COL24A1Q17RW2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
COL24A1Q17RW2 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
COL24A1Q17RW2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
COL24A1Q17RW2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
COL24A1Q17RW2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
COL24A1Q17RW2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
COL24A1Q17RW2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
COL24A1Q17RW2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
COL24A1Q17RW2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.48
COL24A1Q17RW2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
COL24A1Q17RW2 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
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