Protein–RNA interactions for Protein: Q16828

DUSP6, Dual specificity protein phosphatase 6, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP6Q16828 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DUSP6Q16828 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DUSP6Q16828 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DUSP6Q16828 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DUSP6Q16828 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DUSP6Q16828 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DUSP6Q16828 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
DUSP6Q16828 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DUSP6Q16828 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DUSP6Q16828 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DUSP6Q16828 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DUSP6Q16828 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DUSP6Q16828 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DUSP6Q16828 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DUSP6Q16828 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DUSP6Q16828 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DUSP6Q16828 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DUSP6Q16828 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
DUSP6Q16828 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DUSP6Q16828 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DUSP6Q16828 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DUSP6Q16828 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DUSP6Q16828 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DUSP6Q16828 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DUSP6Q16828 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DUSP6Q16828 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
DUSP6Q16828 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DUSP6Q16828 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DUSP6Q16828 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
DUSP6Q16828 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DUSP6Q16828 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DUSP6Q16828 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
DUSP6Q16828 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
DUSP6Q16828 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
DUSP6Q16828 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
DUSP6Q16828 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DUSP6Q16828 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DUSP6Q16828 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DUSP6Q16828 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DUSP6Q16828 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DUSP6Q16828 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DUSP6Q16828 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DUSP6Q16828 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DUSP6Q16828 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DUSP6Q16828 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DUSP6Q16828 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DUSP6Q16828 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DUSP6Q16828 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DUSP6Q16828 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DUSP6Q16828 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DUSP6Q16828 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DUSP6Q16828 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
DUSP6Q16828 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
DUSP6Q16828 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
DUSP6Q16828 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
DUSP6Q16828 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DUSP6Q16828 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DUSP6Q16828 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DUSP6Q16828 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DUSP6Q16828 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DUSP6Q16828 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DUSP6Q16828 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DUSP6Q16828 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DUSP6Q16828 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DUSP6Q16828 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DUSP6Q16828 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
DUSP6Q16828 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DUSP6Q16828 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DUSP6Q16828 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DUSP6Q16828 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DUSP6Q16828 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DUSP6Q16828 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
DUSP6Q16828 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DUSP6Q16828 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DUSP6Q16828 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DUSP6Q16828 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
DUSP6Q16828 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
DUSP6Q16828 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DUSP6Q16828 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DUSP6Q16828 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DUSP6Q16828 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DUSP6Q16828 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
DUSP6Q16828 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DUSP6Q16828 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DUSP6Q16828 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DUSP6Q16828 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DUSP6Q16828 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DUSP6Q16828 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DUSP6Q16828 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DUSP6Q16828 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
DUSP6Q16828 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DUSP6Q16828 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DUSP6Q16828 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DUSP6Q16828 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DUSP6Q16828 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DUSP6Q16828 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DUSP6Q16828 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DUSP6Q16828 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DUSP6Q16828 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DUSP6Q16828 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms