Protein–RNA interactions for Protein: Q15653

NFKBIB, NF-kappa-B inhibitor beta, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIBQ15653 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NFKBIBQ15653 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NFKBIBQ15653 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
NFKBIBQ15653 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
NFKBIBQ15653 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NFKBIBQ15653 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NFKBIBQ15653 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NFKBIBQ15653 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NFKBIBQ15653 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NFKBIBQ15653 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NFKBIBQ15653 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NFKBIBQ15653 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NFKBIBQ15653 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NFKBIBQ15653 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NFKBIBQ15653 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NFKBIBQ15653 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
NFKBIBQ15653 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NFKBIBQ15653 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NFKBIBQ15653 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NFKBIBQ15653 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NFKBIBQ15653 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
NFKBIBQ15653 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NFKBIBQ15653 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NFKBIBQ15653 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NFKBIBQ15653 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NFKBIBQ15653 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NFKBIBQ15653 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NFKBIBQ15653 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NFKBIBQ15653 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NFKBIBQ15653 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NFKBIBQ15653 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NFKBIBQ15653 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NFKBIBQ15653 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NFKBIBQ15653 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NFKBIBQ15653 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
NFKBIBQ15653 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
NFKBIBQ15653 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NFKBIBQ15653 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NFKBIBQ15653 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NFKBIBQ15653 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NFKBIBQ15653 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NFKBIBQ15653 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
NFKBIBQ15653 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NFKBIBQ15653 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
NFKBIBQ15653 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NFKBIBQ15653 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NFKBIBQ15653 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NFKBIBQ15653 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NFKBIBQ15653 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NFKBIBQ15653 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
NFKBIBQ15653 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NFKBIBQ15653 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NFKBIBQ15653 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NFKBIBQ15653 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NFKBIBQ15653 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NFKBIBQ15653 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NFKBIBQ15653 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
NFKBIBQ15653 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NFKBIBQ15653 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NFKBIBQ15653 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
NFKBIBQ15653 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NFKBIBQ15653 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NFKBIBQ15653 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NFKBIBQ15653 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
NFKBIBQ15653 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NFKBIBQ15653 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NFKBIBQ15653 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NFKBIBQ15653 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NFKBIBQ15653 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NFKBIBQ15653 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NFKBIBQ15653 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NFKBIBQ15653 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NFKBIBQ15653 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NFKBIBQ15653 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NFKBIBQ15653 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NFKBIBQ15653 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
NFKBIBQ15653 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NFKBIBQ15653 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NFKBIBQ15653 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.08
NFKBIBQ15653 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NFKBIBQ15653 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NFKBIBQ15653 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NFKBIBQ15653 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NFKBIBQ15653 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NFKBIBQ15653 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NFKBIBQ15653 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NFKBIBQ15653 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NFKBIBQ15653 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NFKBIBQ15653 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NFKBIBQ15653 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NFKBIBQ15653 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NFKBIBQ15653 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NFKBIBQ15653 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NFKBIBQ15653 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NFKBIBQ15653 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NFKBIBQ15653 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NFKBIBQ15653 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NFKBIBQ15653 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NFKBIBQ15653 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NFKBIBQ15653 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms