Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RYR3Q15413 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RYR3Q15413 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RYR3Q15413 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
RYR3Q15413 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RYR3Q15413 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC16.64■□□□□ 0.26
RYR3Q15413 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RYR3Q15413 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
RYR3Q15413 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
RYR3Q15413 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RYR3Q15413 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RYR3Q15413 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RYR3Q15413 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
RYR3Q15413 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RYR3Q15413 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RYR3Q15413 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RYR3Q15413 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RYR3Q15413 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RYR3Q15413 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
RYR3Q15413 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RYR3Q15413 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RYR3Q15413 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RYR3Q15413 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RYR3Q15413 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RYR3Q15413 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RYR3Q15413 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RYR3Q15413 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RYR3Q15413 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
RYR3Q15413 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RYR3Q15413 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RYR3Q15413 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RYR3Q15413 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
RYR3Q15413 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RYR3Q15413 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RYR3Q15413 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RYR3Q15413 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RYR3Q15413 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RYR3Q15413 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RYR3Q15413 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RYR3Q15413 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RYR3Q15413 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RYR3Q15413 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RYR3Q15413 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RYR3Q15413 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RYR3Q15413 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RYR3Q15413 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RYR3Q15413 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RYR3Q15413 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RYR3Q15413 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RYR3Q15413 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RYR3Q15413 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RYR3Q15413 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RYR3Q15413 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RYR3Q15413 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RYR3Q15413 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RYR3Q15413 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RYR3Q15413 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RYR3Q15413 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RYR3Q15413 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RYR3Q15413 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RYR3Q15413 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RYR3Q15413 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RYR3Q15413 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RYR3Q15413 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RYR3Q15413 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RYR3Q15413 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RYR3Q15413 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RYR3Q15413 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RYR3Q15413 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RYR3Q15413 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RYR3Q15413 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RYR3Q15413 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RYR3Q15413 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RYR3Q15413 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RYR3Q15413 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RYR3Q15413 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RYR3Q15413 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RYR3Q15413 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RYR3Q15413 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RYR3Q15413 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RYR3Q15413 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RYR3Q15413 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RYR3Q15413 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RYR3Q15413 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RYR3Q15413 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RYR3Q15413 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RYR3Q15413 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RYR3Q15413 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RYR3Q15413 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RYR3Q15413 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RYR3Q15413 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RYR3Q15413 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RYR3Q15413 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RYR3Q15413 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RYR3Q15413 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RYR3Q15413 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RYR3Q15413 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RYR3Q15413 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RYR3Q15413 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RYR3Q15413 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
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