Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
PTPRKQ15262 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
PTPRKQ15262 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
PTPRKQ15262 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
PTPRKQ15262 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
PTPRKQ15262 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
PTPRKQ15262 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
PTPRKQ15262 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
PTPRKQ15262 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
PTPRKQ15262 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
PTPRKQ15262 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
PTPRKQ15262 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
PTPRKQ15262 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC36.41■■■■□ 3.42
PTPRKQ15262 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
PTPRKQ15262 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
PTPRKQ15262 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
PTPRKQ15262 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
PTPRKQ15262 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
PTPRKQ15262 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
PTPRKQ15262 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC36.39■■■■□ 3.42
PTPRKQ15262 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
PTPRKQ15262 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
PTPRKQ15262 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC36.39■■■■□ 3.42
PTPRKQ15262 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
PTPRKQ15262 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
PTPRKQ15262 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
PTPRKQ15262 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
PTPRKQ15262 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
PTPRKQ15262 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
PTPRKQ15262 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
PTPRKQ15262 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
PTPRKQ15262 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
PTPRKQ15262 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
PTPRKQ15262 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
PTPRKQ15262 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
PTPRKQ15262 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
PTPRKQ15262 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
PTPRKQ15262 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
PTPRKQ15262 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
PTPRKQ15262 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
PTPRKQ15262 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
PTPRKQ15262 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
PTPRKQ15262 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC36.35■■■■□ 3.41
PTPRKQ15262 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
PTPRKQ15262 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
PTPRKQ15262 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
PTPRKQ15262 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
PTPRKQ15262 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
PTPRKQ15262 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
PTPRKQ15262 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
PTPRKQ15262 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
PTPRKQ15262 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
PTPRKQ15262 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
PTPRKQ15262 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
PTPRKQ15262 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.41
PTPRKQ15262 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
PTPRKQ15262 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
PTPRKQ15262 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
PTPRKQ15262 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.4
PTPRKQ15262 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.4
PTPRKQ15262 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
PTPRKQ15262 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
PTPRKQ15262 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
PTPRKQ15262 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
PTPRKQ15262 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
PTPRKQ15262 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
PTPRKQ15262 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
PTPRKQ15262 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
PTPRKQ15262 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
PTPRKQ15262 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
PTPRKQ15262 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC36.27■■■■□ 3.4
PTPRKQ15262 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
PTPRKQ15262 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
PTPRKQ15262 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
PTPRKQ15262 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
PTPRKQ15262 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
PTPRKQ15262 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
PTPRKQ15262 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
PTPRKQ15262 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
PTPRKQ15262 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
PTPRKQ15262 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC36.25■■■■□ 3.39
PTPRKQ15262 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
PTPRKQ15262 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC36.25■■■■□ 3.39
PTPRKQ15262 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
PTPRKQ15262 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
PTPRKQ15262 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC36.24■■■■□ 3.39
PTPRKQ15262 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
PTPRKQ15262 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
PTPRKQ15262 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
PTPRKQ15262 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC36.23■■■■□ 3.39
PTPRKQ15262 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
PTPRKQ15262 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
PTPRKQ15262 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
PTPRKQ15262 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
PTPRKQ15262 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
PTPRKQ15262 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
PTPRKQ15262 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
PTPRKQ15262 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
PTPRKQ15262 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
PTPRKQ15262 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
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