Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LAPTM4AQ15012 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LAPTM4AQ15012 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LAPTM4AQ15012 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LAPTM4AQ15012 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LAPTM4AQ15012 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LAPTM4AQ15012 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LAPTM4AQ15012 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LAPTM4AQ15012 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LAPTM4AQ15012 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LAPTM4AQ15012 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LAPTM4AQ15012 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LAPTM4AQ15012 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LAPTM4AQ15012 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LAPTM4AQ15012 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LAPTM4AQ15012 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LAPTM4AQ15012 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LAPTM4AQ15012 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LAPTM4AQ15012 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LAPTM4AQ15012 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LAPTM4AQ15012 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LAPTM4AQ15012 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LAPTM4AQ15012 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LAPTM4AQ15012 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LAPTM4AQ15012 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LAPTM4AQ15012 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LAPTM4AQ15012 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LAPTM4AQ15012 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LAPTM4AQ15012 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LAPTM4AQ15012 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LAPTM4AQ15012 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LAPTM4AQ15012 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LAPTM4AQ15012 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LAPTM4AQ15012 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LAPTM4AQ15012 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LAPTM4AQ15012 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LAPTM4AQ15012 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LAPTM4AQ15012 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LAPTM4AQ15012 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LAPTM4AQ15012 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LAPTM4AQ15012 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LAPTM4AQ15012 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAPTM4AQ15012 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAPTM4AQ15012 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAPTM4AQ15012 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LAPTM4AQ15012 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LAPTM4AQ15012 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LAPTM4AQ15012 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LAPTM4AQ15012 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LAPTM4AQ15012 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LAPTM4AQ15012 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LAPTM4AQ15012 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LAPTM4AQ15012 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LAPTM4AQ15012 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LAPTM4AQ15012 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LAPTM4AQ15012 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LAPTM4AQ15012 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LAPTM4AQ15012 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LAPTM4AQ15012 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LAPTM4AQ15012 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LAPTM4AQ15012 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LAPTM4AQ15012 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LAPTM4AQ15012 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LAPTM4AQ15012 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LAPTM4AQ15012 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LAPTM4AQ15012 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LAPTM4AQ15012 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LAPTM4AQ15012 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LAPTM4AQ15012 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LAPTM4AQ15012 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LAPTM4AQ15012 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LAPTM4AQ15012 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LAPTM4AQ15012 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LAPTM4AQ15012 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LAPTM4AQ15012 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LAPTM4AQ15012 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LAPTM4AQ15012 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LAPTM4AQ15012 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LAPTM4AQ15012 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LAPTM4AQ15012 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LAPTM4AQ15012 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LAPTM4AQ15012 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LAPTM4AQ15012 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LAPTM4AQ15012 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LAPTM4AQ15012 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LAPTM4AQ15012 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LAPTM4AQ15012 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LAPTM4AQ15012 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LAPTM4AQ15012 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LAPTM4AQ15012 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LAPTM4AQ15012 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LAPTM4AQ15012 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LAPTM4AQ15012 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LAPTM4AQ15012 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LAPTM4AQ15012 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LAPTM4AQ15012 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LAPTM4AQ15012 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LAPTM4AQ15012 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LAPTM4AQ15012 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LAPTM4AQ15012 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
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