Protein–RNA interactions for Protein: Q14973

SLC10A1, Sodium/bile acid cotransporter, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A1Q14973 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC10A1Q14973 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC10A1Q14973 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC10A1Q14973 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC10A1Q14973 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC10A1Q14973 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC10A1Q14973 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC10A1Q14973 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC10A1Q14973 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC10A1Q14973 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC10A1Q14973 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC10A1Q14973 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC10A1Q14973 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC10A1Q14973 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC10A1Q14973 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC10A1Q14973 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC10A1Q14973 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC10A1Q14973 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC10A1Q14973 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC10A1Q14973 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC10A1Q14973 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC10A1Q14973 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC10A1Q14973 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC10A1Q14973 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC10A1Q14973 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC10A1Q14973 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC10A1Q14973 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC10A1Q14973 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC10A1Q14973 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC10A1Q14973 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC10A1Q14973 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC10A1Q14973 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC10A1Q14973 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC10A1Q14973 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC10A1Q14973 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC10A1Q14973 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC10A1Q14973 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC10A1Q14973 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC10A1Q14973 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC10A1Q14973 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC10A1Q14973 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC10A1Q14973 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC10A1Q14973 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC10A1Q14973 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC10A1Q14973 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC10A1Q14973 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC10A1Q14973 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC10A1Q14973 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC10A1Q14973 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC10A1Q14973 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC10A1Q14973 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC10A1Q14973 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC10A1Q14973 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC10A1Q14973 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC10A1Q14973 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC10A1Q14973 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC10A1Q14973 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC10A1Q14973 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC10A1Q14973 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC10A1Q14973 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC10A1Q14973 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC10A1Q14973 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC10A1Q14973 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC10A1Q14973 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC10A1Q14973 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC10A1Q14973 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC10A1Q14973 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC10A1Q14973 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC10A1Q14973 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC10A1Q14973 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC10A1Q14973 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC10A1Q14973 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC10A1Q14973 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC10A1Q14973 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC10A1Q14973 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC10A1Q14973 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC10A1Q14973 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC10A1Q14973 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC10A1Q14973 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC10A1Q14973 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC10A1Q14973 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC10A1Q14973 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC10A1Q14973 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC10A1Q14973 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC10A1Q14973 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC10A1Q14973 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC10A1Q14973 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC10A1Q14973 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SLC10A1Q14973 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC10A1Q14973 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC10A1Q14973 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC10A1Q14973 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC10A1Q14973 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC10A1Q14973 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC10A1Q14973 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC10A1Q14973 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC10A1Q14973 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC10A1Q14973 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC10A1Q14973 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC10A1Q14973 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.9 ms