Protein–RNA interactions for Protein: Q14515

SPARCL1, SPARC-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPARCL1Q14515 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPARCL1Q14515 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPARCL1Q14515 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPARCL1Q14515 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPARCL1Q14515 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SPARCL1Q14515 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SPARCL1Q14515 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SPARCL1Q14515 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPARCL1Q14515 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPARCL1Q14515 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPARCL1Q14515 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPARCL1Q14515 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPARCL1Q14515 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPARCL1Q14515 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPARCL1Q14515 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPARCL1Q14515 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPARCL1Q14515 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPARCL1Q14515 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPARCL1Q14515 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPARCL1Q14515 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPARCL1Q14515 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SPARCL1Q14515 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPARCL1Q14515 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPARCL1Q14515 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPARCL1Q14515 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPARCL1Q14515 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPARCL1Q14515 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPARCL1Q14515 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPARCL1Q14515 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPARCL1Q14515 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPARCL1Q14515 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPARCL1Q14515 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPARCL1Q14515 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPARCL1Q14515 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPARCL1Q14515 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPARCL1Q14515 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPARCL1Q14515 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPARCL1Q14515 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPARCL1Q14515 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPARCL1Q14515 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPARCL1Q14515 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SPARCL1Q14515 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SPARCL1Q14515 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SPARCL1Q14515 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SPARCL1Q14515 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPARCL1Q14515 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPARCL1Q14515 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPARCL1Q14515 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPARCL1Q14515 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPARCL1Q14515 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPARCL1Q14515 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPARCL1Q14515 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPARCL1Q14515 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPARCL1Q14515 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPARCL1Q14515 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPARCL1Q14515 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPARCL1Q14515 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPARCL1Q14515 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPARCL1Q14515 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPARCL1Q14515 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPARCL1Q14515 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPARCL1Q14515 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPARCL1Q14515 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SPARCL1Q14515 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPARCL1Q14515 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPARCL1Q14515 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPARCL1Q14515 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPARCL1Q14515 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPARCL1Q14515 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPARCL1Q14515 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPARCL1Q14515 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPARCL1Q14515 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SPARCL1Q14515 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPARCL1Q14515 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPARCL1Q14515 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPARCL1Q14515 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPARCL1Q14515 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SPARCL1Q14515 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPARCL1Q14515 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPARCL1Q14515 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPARCL1Q14515 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPARCL1Q14515 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPARCL1Q14515 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SPARCL1Q14515 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPARCL1Q14515 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPARCL1Q14515 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SPARCL1Q14515 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SPARCL1Q14515 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SPARCL1Q14515 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SPARCL1Q14515 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPARCL1Q14515 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPARCL1Q14515 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPARCL1Q14515 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPARCL1Q14515 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPARCL1Q14515 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPARCL1Q14515 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPARCL1Q14515 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPARCL1Q14515 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPARCL1Q14515 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPARCL1Q14515 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms