Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCARB2Q14108 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCARB2Q14108 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCARB2Q14108 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCARB2Q14108 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCARB2Q14108 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCARB2Q14108 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCARB2Q14108 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCARB2Q14108 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCARB2Q14108 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCARB2Q14108 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCARB2Q14108 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCARB2Q14108 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCARB2Q14108 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCARB2Q14108 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SCARB2Q14108 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCARB2Q14108 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCARB2Q14108 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCARB2Q14108 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCARB2Q14108 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCARB2Q14108 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCARB2Q14108 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCARB2Q14108 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCARB2Q14108 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCARB2Q14108 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCARB2Q14108 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SCARB2Q14108 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCARB2Q14108 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCARB2Q14108 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCARB2Q14108 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCARB2Q14108 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCARB2Q14108 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCARB2Q14108 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCARB2Q14108 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCARB2Q14108 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCARB2Q14108 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SCARB2Q14108 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCARB2Q14108 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCARB2Q14108 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCARB2Q14108 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCARB2Q14108 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCARB2Q14108 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCARB2Q14108 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCARB2Q14108 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCARB2Q14108 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCARB2Q14108 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SCARB2Q14108 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCARB2Q14108 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCARB2Q14108 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCARB2Q14108 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCARB2Q14108 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCARB2Q14108 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCARB2Q14108 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCARB2Q14108 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCARB2Q14108 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCARB2Q14108 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SCARB2Q14108 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCARB2Q14108 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCARB2Q14108 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCARB2Q14108 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCARB2Q14108 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCARB2Q14108 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCARB2Q14108 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCARB2Q14108 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCARB2Q14108 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCARB2Q14108 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCARB2Q14108 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SCARB2Q14108 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCARB2Q14108 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCARB2Q14108 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCARB2Q14108 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCARB2Q14108 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCARB2Q14108 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCARB2Q14108 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCARB2Q14108 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCARB2Q14108 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCARB2Q14108 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCARB2Q14108 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCARB2Q14108 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCARB2Q14108 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCARB2Q14108 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCARB2Q14108 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCARB2Q14108 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCARB2Q14108 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCARB2Q14108 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SCARB2Q14108 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCARB2Q14108 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCARB2Q14108 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCARB2Q14108 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCARB2Q14108 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCARB2Q14108 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCARB2Q14108 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCARB2Q14108 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCARB2Q14108 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SCARB2Q14108 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCARB2Q14108 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCARB2Q14108 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCARB2Q14108 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCARB2Q14108 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCARB2Q14108 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
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