Protein–RNA interactions for Protein: Q08629

SPOCK1, Testican-1, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK1Q08629 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SPOCK1Q08629 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SPOCK1Q08629 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SPOCK1Q08629 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SPOCK1Q08629 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SPOCK1Q08629 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SPOCK1Q08629 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SPOCK1Q08629 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SPOCK1Q08629 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SPOCK1Q08629 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPOCK1Q08629 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPOCK1Q08629 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPOCK1Q08629 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPOCK1Q08629 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SPOCK1Q08629 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPOCK1Q08629 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPOCK1Q08629 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPOCK1Q08629 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPOCK1Q08629 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SPOCK1Q08629 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPOCK1Q08629 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPOCK1Q08629 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPOCK1Q08629 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPOCK1Q08629 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPOCK1Q08629 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPOCK1Q08629 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPOCK1Q08629 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SPOCK1Q08629 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPOCK1Q08629 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPOCK1Q08629 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPOCK1Q08629 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPOCK1Q08629 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPOCK1Q08629 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPOCK1Q08629 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPOCK1Q08629 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPOCK1Q08629 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPOCK1Q08629 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPOCK1Q08629 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPOCK1Q08629 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPOCK1Q08629 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPOCK1Q08629 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPOCK1Q08629 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SPOCK1Q08629 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPOCK1Q08629 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPOCK1Q08629 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPOCK1Q08629 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SPOCK1Q08629 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SPOCK1Q08629 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SPOCK1Q08629 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SPOCK1Q08629 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SPOCK1Q08629 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPOCK1Q08629 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPOCK1Q08629 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPOCK1Q08629 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPOCK1Q08629 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPOCK1Q08629 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPOCK1Q08629 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPOCK1Q08629 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPOCK1Q08629 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPOCK1Q08629 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPOCK1Q08629 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPOCK1Q08629 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPOCK1Q08629 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPOCK1Q08629 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPOCK1Q08629 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPOCK1Q08629 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPOCK1Q08629 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPOCK1Q08629 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPOCK1Q08629 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPOCK1Q08629 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPOCK1Q08629 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPOCK1Q08629 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPOCK1Q08629 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPOCK1Q08629 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPOCK1Q08629 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPOCK1Q08629 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPOCK1Q08629 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPOCK1Q08629 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPOCK1Q08629 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPOCK1Q08629 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPOCK1Q08629 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPOCK1Q08629 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPOCK1Q08629 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPOCK1Q08629 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPOCK1Q08629 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPOCK1Q08629 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPOCK1Q08629 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPOCK1Q08629 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SPOCK1Q08629 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPOCK1Q08629 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPOCK1Q08629 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPOCK1Q08629 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SPOCK1Q08629 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPOCK1Q08629 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPOCK1Q08629 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPOCK1Q08629 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPOCK1Q08629 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPOCK1Q08629 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPOCK1Q08629 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPOCK1Q08629 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms