Protein–RNA interactions for Protein: Q06330

RBPJ, Recombining binding protein suppressor of hairless, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBPJQ06330 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RBPJQ06330 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RBPJQ06330 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RBPJQ06330 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RBPJQ06330 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RBPJQ06330 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RBPJQ06330 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RBPJQ06330 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RBPJQ06330 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RBPJQ06330 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RBPJQ06330 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RBPJQ06330 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RBPJQ06330 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RBPJQ06330 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RBPJQ06330 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RBPJQ06330 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RBPJQ06330 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RBPJQ06330 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RBPJQ06330 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RBPJQ06330 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RBPJQ06330 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RBPJQ06330 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RBPJQ06330 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RBPJQ06330 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RBPJQ06330 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RBPJQ06330 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RBPJQ06330 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RBPJQ06330 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RBPJQ06330 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RBPJQ06330 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RBPJQ06330 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RBPJQ06330 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RBPJQ06330 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RBPJQ06330 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RBPJQ06330 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RBPJQ06330 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RBPJQ06330 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RBPJQ06330 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RBPJQ06330 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RBPJQ06330 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RBPJQ06330 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RBPJQ06330 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RBPJQ06330 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RBPJQ06330 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RBPJQ06330 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RBPJQ06330 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RBPJQ06330 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RBPJQ06330 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RBPJQ06330 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RBPJQ06330 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RBPJQ06330 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RBPJQ06330 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RBPJQ06330 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RBPJQ06330 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RBPJQ06330 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RBPJQ06330 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RBPJQ06330 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RBPJQ06330 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RBPJQ06330 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RBPJQ06330 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RBPJQ06330 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RBPJQ06330 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RBPJQ06330 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RBPJQ06330 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RBPJQ06330 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RBPJQ06330 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RBPJQ06330 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RBPJQ06330 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RBPJQ06330 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RBPJQ06330 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RBPJQ06330 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RBPJQ06330 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RBPJQ06330 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RBPJQ06330 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RBPJQ06330 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RBPJQ06330 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RBPJQ06330 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RBPJQ06330 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RBPJQ06330 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RBPJQ06330 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RBPJQ06330 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RBPJQ06330 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RBPJQ06330 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RBPJQ06330 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RBPJQ06330 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RBPJQ06330 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RBPJQ06330 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RBPJQ06330 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RBPJQ06330 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RBPJQ06330 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RBPJQ06330 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RBPJQ06330 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RBPJQ06330 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RBPJQ06330 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RBPJQ06330 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RBPJQ06330 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RBPJQ06330 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RBPJQ06330 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RBPJQ06330 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RBPJQ06330 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms