Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
UBE3AQ05086 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
UBE3AQ05086 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
UBE3AQ05086 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
UBE3AQ05086 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
UBE3AQ05086 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
UBE3AQ05086 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
UBE3AQ05086 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
UBE3AQ05086 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
UBE3AQ05086 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
UBE3AQ05086 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
UBE3AQ05086 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
UBE3AQ05086 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
UBE3AQ05086 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
UBE3AQ05086 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
UBE3AQ05086 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
UBE3AQ05086 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
UBE3AQ05086 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
UBE3AQ05086 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
UBE3AQ05086 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
UBE3AQ05086 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
UBE3AQ05086 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
UBE3AQ05086 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
UBE3AQ05086 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
UBE3AQ05086 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
UBE3AQ05086 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
UBE3AQ05086 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
UBE3AQ05086 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
UBE3AQ05086 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
UBE3AQ05086 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
UBE3AQ05086 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
UBE3AQ05086 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
UBE3AQ05086 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
UBE3AQ05086 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
UBE3AQ05086 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
UBE3AQ05086 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
UBE3AQ05086 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
UBE3AQ05086 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
UBE3AQ05086 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBE3AQ05086 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBE3AQ05086 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBE3AQ05086 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBE3AQ05086 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBE3AQ05086 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBE3AQ05086 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBE3AQ05086 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
UBE3AQ05086 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
UBE3AQ05086 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
UBE3AQ05086 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
UBE3AQ05086 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
UBE3AQ05086 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
UBE3AQ05086 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
UBE3AQ05086 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
UBE3AQ05086 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
UBE3AQ05086 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
UBE3AQ05086 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
UBE3AQ05086 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
UBE3AQ05086 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
UBE3AQ05086 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
UBE3AQ05086 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
UBE3AQ05086 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
UBE3AQ05086 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
UBE3AQ05086 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
UBE3AQ05086 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
UBE3AQ05086 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
UBE3AQ05086 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
UBE3AQ05086 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBE3AQ05086 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBE3AQ05086 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBE3AQ05086 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBE3AQ05086 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBE3AQ05086 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBE3AQ05086 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
UBE3AQ05086 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBE3AQ05086 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
UBE3AQ05086 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
UBE3AQ05086 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
UBE3AQ05086 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
UBE3AQ05086 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
UBE3AQ05086 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
UBE3AQ05086 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBE3AQ05086 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBE3AQ05086 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBE3AQ05086 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBE3AQ05086 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBE3AQ05086 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBE3AQ05086 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBE3AQ05086 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBE3AQ05086 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBE3AQ05086 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBE3AQ05086 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBE3AQ05086 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBE3AQ05086 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBE3AQ05086 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBE3AQ05086 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBE3AQ05086 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBE3AQ05086 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
UBE3AQ05086 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBE3AQ05086 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBE3AQ05086 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms