Protein–RNA interactions for Protein: Q01973

ROR1, Inactive tyrosine-protein kinase transmembrane receptor ROR1, humanhuman

Predictions only

Length 937 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROR1Q01973 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ROR1Q01973 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ROR1Q01973 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ROR1Q01973 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ROR1Q01973 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ROR1Q01973 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ROR1Q01973 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ROR1Q01973 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ROR1Q01973 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
ROR1Q01973 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ROR1Q01973 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ROR1Q01973 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ROR1Q01973 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ROR1Q01973 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ROR1Q01973 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ROR1Q01973 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ROR1Q01973 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ROR1Q01973 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ROR1Q01973 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ROR1Q01973 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ROR1Q01973 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ROR1Q01973 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ROR1Q01973 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ROR1Q01973 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ROR1Q01973 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ROR1Q01973 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ROR1Q01973 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ROR1Q01973 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ROR1Q01973 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ROR1Q01973 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ROR1Q01973 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ROR1Q01973 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ROR1Q01973 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ROR1Q01973 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ROR1Q01973 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ROR1Q01973 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ROR1Q01973 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ROR1Q01973 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ROR1Q01973 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ROR1Q01973 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ROR1Q01973 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ROR1Q01973 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ROR1Q01973 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
ROR1Q01973 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ROR1Q01973 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ROR1Q01973 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ROR1Q01973 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ROR1Q01973 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ROR1Q01973 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ROR1Q01973 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ROR1Q01973 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ROR1Q01973 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ROR1Q01973 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ROR1Q01973 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ROR1Q01973 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ROR1Q01973 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ROR1Q01973 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ROR1Q01973 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ROR1Q01973 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ROR1Q01973 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ROR1Q01973 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ROR1Q01973 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ROR1Q01973 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ROR1Q01973 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ROR1Q01973 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ROR1Q01973 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ROR1Q01973 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ROR1Q01973 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ROR1Q01973 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ROR1Q01973 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
ROR1Q01973 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ROR1Q01973 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ROR1Q01973 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ROR1Q01973 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ROR1Q01973 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
ROR1Q01973 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ROR1Q01973 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ROR1Q01973 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ROR1Q01973 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ROR1Q01973 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ROR1Q01973 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ROR1Q01973 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ROR1Q01973 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
ROR1Q01973 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ROR1Q01973 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ROR1Q01973 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ROR1Q01973 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ROR1Q01973 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ROR1Q01973 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ROR1Q01973 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ROR1Q01973 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ROR1Q01973 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ROR1Q01973 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ROR1Q01973 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ROR1Q01973 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ROR1Q01973 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ROR1Q01973 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ROR1Q01973 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ROR1Q01973 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ROR1Q01973 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.5 ms