Protein–RNA interactions for Protein: Q00597

FANCC, Fanconi anemia group C protein, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCCQ00597 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FANCCQ00597 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
FANCCQ00597 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FANCCQ00597 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
FANCCQ00597 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FANCCQ00597 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
FANCCQ00597 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
FANCCQ00597 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
FANCCQ00597 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FANCCQ00597 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
FANCCQ00597 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
FANCCQ00597 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
FANCCQ00597 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
FANCCQ00597 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
FANCCQ00597 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
FANCCQ00597 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
FANCCQ00597 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
FANCCQ00597 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
FANCCQ00597 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
FANCCQ00597 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
FANCCQ00597 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
FANCCQ00597 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
FANCCQ00597 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
FANCCQ00597 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
FANCCQ00597 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
FANCCQ00597 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
FANCCQ00597 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
FANCCQ00597 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
FANCCQ00597 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FANCCQ00597 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
FANCCQ00597 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FANCCQ00597 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FANCCQ00597 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FANCCQ00597 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FANCCQ00597 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FANCCQ00597 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
FANCCQ00597 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FANCCQ00597 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
FANCCQ00597 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
FANCCQ00597 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
FANCCQ00597 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
FANCCQ00597 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
FANCCQ00597 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
FANCCQ00597 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
FANCCQ00597 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FANCCQ00597 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FANCCQ00597 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
FANCCQ00597 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FANCCQ00597 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
FANCCQ00597 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FANCCQ00597 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
FANCCQ00597 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FANCCQ00597 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
FANCCQ00597 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FANCCQ00597 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
FANCCQ00597 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FANCCQ00597 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
FANCCQ00597 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
FANCCQ00597 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
FANCCQ00597 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
FANCCQ00597 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FANCCQ00597 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
FANCCQ00597 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
FANCCQ00597 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FANCCQ00597 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
FANCCQ00597 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FANCCQ00597 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FANCCQ00597 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FANCCQ00597 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FANCCQ00597 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FANCCQ00597 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FANCCQ00597 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FANCCQ00597 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
FANCCQ00597 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FANCCQ00597 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FANCCQ00597 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
FANCCQ00597 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FANCCQ00597 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
FANCCQ00597 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
FANCCQ00597 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FANCCQ00597 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FANCCQ00597 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FANCCQ00597 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
FANCCQ00597 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
FANCCQ00597 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
FANCCQ00597 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
FANCCQ00597 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
FANCCQ00597 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
FANCCQ00597 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
FANCCQ00597 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
FANCCQ00597 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
FANCCQ00597 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
FANCCQ00597 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
FANCCQ00597 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
FANCCQ00597 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
FANCCQ00597 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
FANCCQ00597 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
FANCCQ00597 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
FANCCQ00597 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
FANCCQ00597 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms