Protein–RNA interactions for Protein: P78414

IRX1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1P78414 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IRX1P78414 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IRX1P78414 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IRX1P78414 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
IRX1P78414 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IRX1P78414 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IRX1P78414 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IRX1P78414 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IRX1P78414 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IRX1P78414 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IRX1P78414 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IRX1P78414 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IRX1P78414 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IRX1P78414 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IRX1P78414 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IRX1P78414 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IRX1P78414 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IRX1P78414 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IRX1P78414 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IRX1P78414 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
IRX1P78414 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IRX1P78414 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IRX1P78414 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IRX1P78414 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IRX1P78414 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IRX1P78414 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
IRX1P78414 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IRX1P78414 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IRX1P78414 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IRX1P78414 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IRX1P78414 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IRX1P78414 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IRX1P78414 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IRX1P78414 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IRX1P78414 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IRX1P78414 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IRX1P78414 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IRX1P78414 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IRX1P78414 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
IRX1P78414 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IRX1P78414 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
IRX1P78414 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IRX1P78414 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IRX1P78414 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IRX1P78414 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IRX1P78414 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IRX1P78414 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IRX1P78414 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IRX1P78414 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IRX1P78414 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IRX1P78414 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IRX1P78414 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IRX1P78414 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IRX1P78414 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IRX1P78414 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IRX1P78414 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IRX1P78414 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IRX1P78414 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IRX1P78414 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IRX1P78414 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IRX1P78414 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IRX1P78414 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IRX1P78414 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IRX1P78414 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IRX1P78414 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IRX1P78414 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IRX1P78414 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IRX1P78414 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IRX1P78414 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IRX1P78414 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
IRX1P78414 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
IRX1P78414 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
IRX1P78414 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IRX1P78414 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IRX1P78414 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IRX1P78414 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IRX1P78414 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IRX1P78414 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IRX1P78414 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IRX1P78414 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
IRX1P78414 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IRX1P78414 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IRX1P78414 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IRX1P78414 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IRX1P78414 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IRX1P78414 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IRX1P78414 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IRX1P78414 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IRX1P78414 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IRX1P78414 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IRX1P78414 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IRX1P78414 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IRX1P78414 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IRX1P78414 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IRX1P78414 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IRX1P78414 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IRX1P78414 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
IRX1P78414 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IRX1P78414 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IRX1P78414 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms