Protein–RNA interactions for Protein: P62304

SNRPE, Small nuclear ribonucleoprotein E, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPEP62304 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNRPEP62304 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SNRPEP62304 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNRPEP62304 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNRPEP62304 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNRPEP62304 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SNRPEP62304 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SNRPEP62304 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNRPEP62304 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNRPEP62304 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNRPEP62304 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNRPEP62304 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNRPEP62304 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNRPEP62304 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNRPEP62304 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNRPEP62304 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNRPEP62304 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNRPEP62304 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNRPEP62304 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNRPEP62304 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNRPEP62304 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNRPEP62304 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNRPEP62304 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNRPEP62304 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNRPEP62304 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNRPEP62304 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNRPEP62304 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNRPEP62304 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNRPEP62304 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNRPEP62304 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNRPEP62304 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNRPEP62304 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNRPEP62304 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNRPEP62304 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNRPEP62304 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNRPEP62304 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNRPEP62304 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNRPEP62304 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNRPEP62304 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNRPEP62304 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNRPEP62304 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNRPEP62304 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNRPEP62304 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNRPEP62304 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNRPEP62304 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNRPEP62304 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNRPEP62304 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNRPEP62304 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNRPEP62304 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNRPEP62304 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNRPEP62304 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNRPEP62304 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNRPEP62304 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNRPEP62304 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNRPEP62304 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNRPEP62304 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNRPEP62304 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNRPEP62304 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNRPEP62304 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNRPEP62304 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNRPEP62304 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNRPEP62304 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNRPEP62304 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNRPEP62304 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SNRPEP62304 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNRPEP62304 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNRPEP62304 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNRPEP62304 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNRPEP62304 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNRPEP62304 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNRPEP62304 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNRPEP62304 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNRPEP62304 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNRPEP62304 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNRPEP62304 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNRPEP62304 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNRPEP62304 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNRPEP62304 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SNRPEP62304 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SNRPEP62304 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SNRPEP62304 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNRPEP62304 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNRPEP62304 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNRPEP62304 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNRPEP62304 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNRPEP62304 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNRPEP62304 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNRPEP62304 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNRPEP62304 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNRPEP62304 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNRPEP62304 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNRPEP62304 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNRPEP62304 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNRPEP62304 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNRPEP62304 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNRPEP62304 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNRPEP62304 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNRPEP62304 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNRPEP62304 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNRPEP62304 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.6 ms