Protein–RNA interactions for Protein: P61218

POLR2F, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2FP61218 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
POLR2FP61218 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
POLR2FP61218 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
POLR2FP61218 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
POLR2FP61218 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
POLR2FP61218 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
POLR2FP61218 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
POLR2FP61218 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
POLR2FP61218 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
POLR2FP61218 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.72
POLR2FP61218 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
POLR2FP61218 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
POLR2FP61218 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
POLR2FP61218 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
POLR2FP61218 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
POLR2FP61218 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
POLR2FP61218 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
POLR2FP61218 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
POLR2FP61218 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
POLR2FP61218 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
POLR2FP61218 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
POLR2FP61218 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
POLR2FP61218 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
POLR2FP61218 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
POLR2FP61218 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
POLR2FP61218 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
POLR2FP61218 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
POLR2FP61218 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
POLR2FP61218 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
POLR2FP61218 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
POLR2FP61218 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
POLR2FP61218 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
POLR2FP61218 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
POLR2FP61218 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
POLR2FP61218 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
POLR2FP61218 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
POLR2FP61218 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
POLR2FP61218 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
POLR2FP61218 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
POLR2FP61218 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
POLR2FP61218 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
POLR2FP61218 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
POLR2FP61218 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
POLR2FP61218 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
POLR2FP61218 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
POLR2FP61218 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
POLR2FP61218 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
POLR2FP61218 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
POLR2FP61218 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
POLR2FP61218 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
POLR2FP61218 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
POLR2FP61218 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
POLR2FP61218 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
POLR2FP61218 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
POLR2FP61218 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
POLR2FP61218 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
POLR2FP61218 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
POLR2FP61218 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
POLR2FP61218 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
POLR2FP61218 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
POLR2FP61218 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
POLR2FP61218 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
POLR2FP61218 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
POLR2FP61218 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
POLR2FP61218 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
POLR2FP61218 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
POLR2FP61218 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
POLR2FP61218 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
POLR2FP61218 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
POLR2FP61218 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
POLR2FP61218 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
POLR2FP61218 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
POLR2FP61218 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
POLR2FP61218 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
POLR2FP61218 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
POLR2FP61218 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
POLR2FP61218 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
POLR2FP61218 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
POLR2FP61218 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
POLR2FP61218 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
POLR2FP61218 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
POLR2FP61218 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
POLR2FP61218 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
POLR2FP61218 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
POLR2FP61218 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
POLR2FP61218 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
POLR2FP61218 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
POLR2FP61218 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
POLR2FP61218 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
POLR2FP61218 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
POLR2FP61218 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
POLR2FP61218 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
POLR2FP61218 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
POLR2FP61218 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
POLR2FP61218 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
POLR2FP61218 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
POLR2FP61218 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
POLR2FP61218 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
POLR2FP61218 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
POLR2FP61218 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.2 ms