Protein–RNA interactions for Protein: P61011

SRP54, Signal recognition particle 54 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP54P61011 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SRP54P61011 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SRP54P61011 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SRP54P61011 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SRP54P61011 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SRP54P61011 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SRP54P61011 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SRP54P61011 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SRP54P61011 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SRP54P61011 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SRP54P61011 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SRP54P61011 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRP54P61011 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRP54P61011 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRP54P61011 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRP54P61011 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRP54P61011 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRP54P61011 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRP54P61011 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRP54P61011 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRP54P61011 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRP54P61011 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRP54P61011 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRP54P61011 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRP54P61011 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRP54P61011 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRP54P61011 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRP54P61011 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRP54P61011 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRP54P61011 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRP54P61011 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRP54P61011 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRP54P61011 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRP54P61011 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRP54P61011 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRP54P61011 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRP54P61011 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRP54P61011 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRP54P61011 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRP54P61011 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRP54P61011 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRP54P61011 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRP54P61011 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRP54P61011 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRP54P61011 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRP54P61011 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRP54P61011 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRP54P61011 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRP54P61011 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRP54P61011 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRP54P61011 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRP54P61011 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRP54P61011 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRP54P61011 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRP54P61011 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SRP54P61011 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SRP54P61011 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SRP54P61011 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SRP54P61011 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SRP54P61011 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SRP54P61011 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SRP54P61011 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SRP54P61011 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SRP54P61011 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRP54P61011 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRP54P61011 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRP54P61011 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRP54P61011 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRP54P61011 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SRP54P61011 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRP54P61011 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRP54P61011 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SRP54P61011 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SRP54P61011 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SRP54P61011 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SRP54P61011 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRP54P61011 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRP54P61011 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRP54P61011 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRP54P61011 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRP54P61011 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SRP54P61011 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SRP54P61011 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SRP54P61011 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SRP54P61011 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SRP54P61011 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SRP54P61011 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SRP54P61011 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SRP54P61011 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SRP54P61011 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SRP54P61011 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SRP54P61011 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SRP54P61011 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SRP54P61011 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SRP54P61011 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRP54P61011 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SRP54P61011 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRP54P61011 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SRP54P61011 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRP54P61011 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms