Protein–RNA interactions for Protein: P55895

RAG2, V(D)J recombination-activating protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAG2P55895 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAG2P55895 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAG2P55895 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAG2P55895 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAG2P55895 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAG2P55895 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAG2P55895 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAG2P55895 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAG2P55895 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAG2P55895 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAG2P55895 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAG2P55895 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAG2P55895 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAG2P55895 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAG2P55895 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAG2P55895 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAG2P55895 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAG2P55895 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAG2P55895 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAG2P55895 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RAG2P55895 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RAG2P55895 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RAG2P55895 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RAG2P55895 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RAG2P55895 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RAG2P55895 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RAG2P55895 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RAG2P55895 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RAG2P55895 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RAG2P55895 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RAG2P55895 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
RAG2P55895 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RAG2P55895 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RAG2P55895 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RAG2P55895 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RAG2P55895 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RAG2P55895 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RAG2P55895 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RAG2P55895 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RAG2P55895 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RAG2P55895 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RAG2P55895 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAG2P55895 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAG2P55895 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
RAG2P55895 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAG2P55895 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAG2P55895 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAG2P55895 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAG2P55895 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAG2P55895 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAG2P55895 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAG2P55895 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAG2P55895 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAG2P55895 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAG2P55895 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAG2P55895 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
RAG2P55895 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAG2P55895 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAG2P55895 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAG2P55895 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAG2P55895 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
RAG2P55895 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
RAG2P55895 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAG2P55895 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
RAG2P55895 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAG2P55895 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAG2P55895 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAG2P55895 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAG2P55895 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
RAG2P55895 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAG2P55895 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
RAG2P55895 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAG2P55895 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAG2P55895 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAG2P55895 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAG2P55895 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAG2P55895 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAG2P55895 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAG2P55895 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAG2P55895 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAG2P55895 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAG2P55895 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAG2P55895 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAG2P55895 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAG2P55895 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAG2P55895 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
RAG2P55895 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAG2P55895 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAG2P55895 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAG2P55895 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAG2P55895 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAG2P55895 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAG2P55895 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAG2P55895 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAG2P55895 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAG2P55895 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAG2P55895 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAG2P55895 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAG2P55895 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAG2P55895 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms