Protein–RNA interactions for Protein: P55210

CASP7, Caspase-7, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP7P55210 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CASP7P55210 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CASP7P55210 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CASP7P55210 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CASP7P55210 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CASP7P55210 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CASP7P55210 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CASP7P55210 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
CASP7P55210 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
CASP7P55210 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CASP7P55210 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CASP7P55210 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CASP7P55210 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CASP7P55210 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CASP7P55210 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CASP7P55210 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CASP7P55210 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CASP7P55210 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CASP7P55210 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CASP7P55210 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CASP7P55210 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CASP7P55210 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CASP7P55210 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CASP7P55210 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CASP7P55210 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CASP7P55210 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CASP7P55210 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC29.95■■■□□ 2.39
CASP7P55210 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
CASP7P55210 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC29.95■■■□□ 2.38
CASP7P55210 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CASP7P55210 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CASP7P55210 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CASP7P55210 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CASP7P55210 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CASP7P55210 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CASP7P55210 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CASP7P55210 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CASP7P55210 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
CASP7P55210 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CASP7P55210 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CASP7P55210 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CASP7P55210 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CASP7P55210 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CASP7P55210 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CASP7P55210 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CASP7P55210 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CASP7P55210 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CASP7P55210 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CASP7P55210 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CASP7P55210 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CASP7P55210 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CASP7P55210 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CASP7P55210 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CASP7P55210 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CASP7P55210 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CASP7P55210 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CASP7P55210 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
CASP7P55210 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CASP7P55210 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CASP7P55210 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CASP7P55210 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CASP7P55210 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CASP7P55210 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
CASP7P55210 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CASP7P55210 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CASP7P55210 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CASP7P55210 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CASP7P55210 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CASP7P55210 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CASP7P55210 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CASP7P55210 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CASP7P55210 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CASP7P55210 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CASP7P55210 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CASP7P55210 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CASP7P55210 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CASP7P55210 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CASP7P55210 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CASP7P55210 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CASP7P55210 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CASP7P55210 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CASP7P55210 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CASP7P55210 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CASP7P55210 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CASP7P55210 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CASP7P55210 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CASP7P55210 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CASP7P55210 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CASP7P55210 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CASP7P55210 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CASP7P55210 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CASP7P55210 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CASP7P55210 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CASP7P55210 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CASP7P55210 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CASP7P55210 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CASP7P55210 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CASP7P55210 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CASP7P55210 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CASP7P55210 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms