Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PGGT1BP53609 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PGGT1BP53609 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PGGT1BP53609 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PGGT1BP53609 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PGGT1BP53609 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PGGT1BP53609 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PGGT1BP53609 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PGGT1BP53609 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PGGT1BP53609 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PGGT1BP53609 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PGGT1BP53609 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PGGT1BP53609 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PGGT1BP53609 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PGGT1BP53609 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PGGT1BP53609 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PGGT1BP53609 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PGGT1BP53609 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PGGT1BP53609 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PGGT1BP53609 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PGGT1BP53609 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PGGT1BP53609 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PGGT1BP53609 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PGGT1BP53609 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PGGT1BP53609 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PGGT1BP53609 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PGGT1BP53609 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PGGT1BP53609 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PGGT1BP53609 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PGGT1BP53609 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PGGT1BP53609 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PGGT1BP53609 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PGGT1BP53609 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PGGT1BP53609 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PGGT1BP53609 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PGGT1BP53609 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PGGT1BP53609 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PGGT1BP53609 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PGGT1BP53609 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PGGT1BP53609 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PGGT1BP53609 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PGGT1BP53609 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PGGT1BP53609 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PGGT1BP53609 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PGGT1BP53609 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PGGT1BP53609 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PGGT1BP53609 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PGGT1BP53609 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PGGT1BP53609 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PGGT1BP53609 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PGGT1BP53609 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PGGT1BP53609 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PGGT1BP53609 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PGGT1BP53609 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PGGT1BP53609 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PGGT1BP53609 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PGGT1BP53609 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PGGT1BP53609 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PGGT1BP53609 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PGGT1BP53609 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PGGT1BP53609 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PGGT1BP53609 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PGGT1BP53609 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PGGT1BP53609 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PGGT1BP53609 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PGGT1BP53609 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PGGT1BP53609 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PGGT1BP53609 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PGGT1BP53609 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PGGT1BP53609 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PGGT1BP53609 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PGGT1BP53609 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PGGT1BP53609 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PGGT1BP53609 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PGGT1BP53609 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PGGT1BP53609 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PGGT1BP53609 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PGGT1BP53609 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PGGT1BP53609 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PGGT1BP53609 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PGGT1BP53609 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PGGT1BP53609 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PGGT1BP53609 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PGGT1BP53609 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PGGT1BP53609 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PGGT1BP53609 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PGGT1BP53609 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PGGT1BP53609 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PGGT1BP53609 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PGGT1BP53609 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PGGT1BP53609 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PGGT1BP53609 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PGGT1BP53609 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PGGT1BP53609 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PGGT1BP53609 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PGGT1BP53609 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PGGT1BP53609 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PGGT1BP53609 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PGGT1BP53609 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PGGT1BP53609 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
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