Protein–RNA interactions for Protein: P51654

GPC3, Glypican-3, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC3P51654 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GPC3P51654 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GPC3P51654 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GPC3P51654 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GPC3P51654 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GPC3P51654 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GPC3P51654 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GPC3P51654 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GPC3P51654 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GPC3P51654 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GPC3P51654 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GPC3P51654 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GPC3P51654 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GPC3P51654 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GPC3P51654 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
GPC3P51654 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GPC3P51654 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GPC3P51654 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GPC3P51654 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GPC3P51654 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GPC3P51654 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GPC3P51654 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GPC3P51654 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GPC3P51654 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GPC3P51654 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GPC3P51654 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GPC3P51654 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GPC3P51654 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GPC3P51654 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GPC3P51654 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GPC3P51654 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GPC3P51654 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GPC3P51654 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GPC3P51654 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GPC3P51654 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GPC3P51654 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GPC3P51654 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GPC3P51654 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GPC3P51654 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GPC3P51654 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GPC3P51654 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GPC3P51654 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GPC3P51654 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GPC3P51654 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GPC3P51654 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
GPC3P51654 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GPC3P51654 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GPC3P51654 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GPC3P51654 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GPC3P51654 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GPC3P51654 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GPC3P51654 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GPC3P51654 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GPC3P51654 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GPC3P51654 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GPC3P51654 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GPC3P51654 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GPC3P51654 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GPC3P51654 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GPC3P51654 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GPC3P51654 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GPC3P51654 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GPC3P51654 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GPC3P51654 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GPC3P51654 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GPC3P51654 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GPC3P51654 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GPC3P51654 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GPC3P51654 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GPC3P51654 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GPC3P51654 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GPC3P51654 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GPC3P51654 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
GPC3P51654 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
GPC3P51654 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GPC3P51654 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GPC3P51654 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GPC3P51654 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GPC3P51654 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GPC3P51654 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GPC3P51654 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GPC3P51654 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GPC3P51654 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GPC3P51654 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GPC3P51654 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GPC3P51654 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GPC3P51654 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GPC3P51654 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GPC3P51654 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GPC3P51654 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GPC3P51654 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
GPC3P51654 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GPC3P51654 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GPC3P51654 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GPC3P51654 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GPC3P51654 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GPC3P51654 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GPC3P51654 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GPC3P51654 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GPC3P51654 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms