Protein–RNA interactions for Protein: P49765

VEGFB, Vascular endothelial growth factor B, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFBP49765 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
VEGFBP49765 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
VEGFBP49765 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
VEGFBP49765 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
VEGFBP49765 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
VEGFBP49765 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
VEGFBP49765 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
VEGFBP49765 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
VEGFBP49765 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
VEGFBP49765 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
VEGFBP49765 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
VEGFBP49765 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
VEGFBP49765 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
VEGFBP49765 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
VEGFBP49765 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
VEGFBP49765 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
VEGFBP49765 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
VEGFBP49765 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
VEGFBP49765 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
VEGFBP49765 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
VEGFBP49765 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
VEGFBP49765 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
VEGFBP49765 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
VEGFBP49765 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
VEGFBP49765 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
VEGFBP49765 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
VEGFBP49765 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
VEGFBP49765 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
VEGFBP49765 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
VEGFBP49765 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
VEGFBP49765 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
VEGFBP49765 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
VEGFBP49765 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
VEGFBP49765 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
VEGFBP49765 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
VEGFBP49765 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
VEGFBP49765 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
VEGFBP49765 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
VEGFBP49765 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
VEGFBP49765 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
VEGFBP49765 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
VEGFBP49765 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
VEGFBP49765 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
VEGFBP49765 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
VEGFBP49765 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
VEGFBP49765 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
VEGFBP49765 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
VEGFBP49765 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
VEGFBP49765 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
VEGFBP49765 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
VEGFBP49765 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
VEGFBP49765 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
VEGFBP49765 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
VEGFBP49765 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
VEGFBP49765 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
VEGFBP49765 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
VEGFBP49765 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
VEGFBP49765 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
VEGFBP49765 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
VEGFBP49765 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
VEGFBP49765 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC28.18■■■□□ 2.1
VEGFBP49765 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
VEGFBP49765 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
VEGFBP49765 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
VEGFBP49765 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
VEGFBP49765 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
VEGFBP49765 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
VEGFBP49765 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
VEGFBP49765 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
VEGFBP49765 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
VEGFBP49765 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
VEGFBP49765 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
VEGFBP49765 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
VEGFBP49765 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
VEGFBP49765 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
VEGFBP49765 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
VEGFBP49765 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
VEGFBP49765 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
VEGFBP49765 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
VEGFBP49765 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
VEGFBP49765 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
VEGFBP49765 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
VEGFBP49765 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
VEGFBP49765 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
VEGFBP49765 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
VEGFBP49765 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
VEGFBP49765 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
VEGFBP49765 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
VEGFBP49765 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
VEGFBP49765 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
VEGFBP49765 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
VEGFBP49765 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
VEGFBP49765 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
VEGFBP49765 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
VEGFBP49765 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
VEGFBP49765 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
VEGFBP49765 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
VEGFBP49765 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
VEGFBP49765 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
VEGFBP49765 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms