Protein–RNA interactions for Protein: P48444

ARCN1, Coatomer subunit delta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARCN1P48444 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARCN1P48444 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARCN1P48444 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARCN1P48444 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARCN1P48444 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARCN1P48444 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
ARCN1P48444 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARCN1P48444 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ARCN1P48444 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARCN1P48444 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARCN1P48444 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARCN1P48444 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARCN1P48444 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARCN1P48444 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARCN1P48444 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ARCN1P48444 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARCN1P48444 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARCN1P48444 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARCN1P48444 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARCN1P48444 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARCN1P48444 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARCN1P48444 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARCN1P48444 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARCN1P48444 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARCN1P48444 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARCN1P48444 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARCN1P48444 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARCN1P48444 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ARCN1P48444 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARCN1P48444 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARCN1P48444 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARCN1P48444 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARCN1P48444 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARCN1P48444 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARCN1P48444 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARCN1P48444 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARCN1P48444 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARCN1P48444 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARCN1P48444 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARCN1P48444 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ARCN1P48444 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ARCN1P48444 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ARCN1P48444 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ARCN1P48444 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ARCN1P48444 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ARCN1P48444 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ARCN1P48444 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARCN1P48444 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ARCN1P48444 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARCN1P48444 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ARCN1P48444 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARCN1P48444 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARCN1P48444 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARCN1P48444 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARCN1P48444 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARCN1P48444 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARCN1P48444 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARCN1P48444 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARCN1P48444 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARCN1P48444 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARCN1P48444 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARCN1P48444 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARCN1P48444 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ARCN1P48444 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ARCN1P48444 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARCN1P48444 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARCN1P48444 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARCN1P48444 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARCN1P48444 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARCN1P48444 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARCN1P48444 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ARCN1P48444 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ARCN1P48444 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ARCN1P48444 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ARCN1P48444 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ARCN1P48444 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ARCN1P48444 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ARCN1P48444 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ARCN1P48444 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ARCN1P48444 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARCN1P48444 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARCN1P48444 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARCN1P48444 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
ARCN1P48444 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARCN1P48444 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARCN1P48444 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARCN1P48444 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARCN1P48444 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ARCN1P48444 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ARCN1P48444 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ARCN1P48444 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ARCN1P48444 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ARCN1P48444 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
ARCN1P48444 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ARCN1P48444 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ARCN1P48444 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ARCN1P48444 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ARCN1P48444 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ARCN1P48444 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ARCN1P48444 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms