Protein–RNA interactions for Protein: P47895

ALDH1A3, Aldehyde dehydrogenase family 1 member A3, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH1A3P47895 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ALDH1A3P47895 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ALDH1A3P47895 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ALDH1A3P47895 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ALDH1A3P47895 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ALDH1A3P47895 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ALDH1A3P47895 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ALDH1A3P47895 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ALDH1A3P47895 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ALDH1A3P47895 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ALDH1A3P47895 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ALDH1A3P47895 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ALDH1A3P47895 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ALDH1A3P47895 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ALDH1A3P47895 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ALDH1A3P47895 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ALDH1A3P47895 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ALDH1A3P47895 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ALDH1A3P47895 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ALDH1A3P47895 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ALDH1A3P47895 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ALDH1A3P47895 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ALDH1A3P47895 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ALDH1A3P47895 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
ALDH1A3P47895 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ALDH1A3P47895 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ALDH1A3P47895 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ALDH1A3P47895 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ALDH1A3P47895 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ALDH1A3P47895 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ALDH1A3P47895 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ALDH1A3P47895 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ALDH1A3P47895 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ALDH1A3P47895 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ALDH1A3P47895 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ALDH1A3P47895 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ALDH1A3P47895 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ALDH1A3P47895 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ALDH1A3P47895 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ALDH1A3P47895 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ALDH1A3P47895 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ALDH1A3P47895 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ALDH1A3P47895 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ALDH1A3P47895 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ALDH1A3P47895 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ALDH1A3P47895 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ALDH1A3P47895 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ALDH1A3P47895 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ALDH1A3P47895 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ALDH1A3P47895 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ALDH1A3P47895 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ALDH1A3P47895 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ALDH1A3P47895 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
ALDH1A3P47895 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ALDH1A3P47895 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ALDH1A3P47895 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ALDH1A3P47895 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ALDH1A3P47895 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ALDH1A3P47895 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
ALDH1A3P47895 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ALDH1A3P47895 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ALDH1A3P47895 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ALDH1A3P47895 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
ALDH1A3P47895 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ALDH1A3P47895 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ALDH1A3P47895 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ALDH1A3P47895 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ALDH1A3P47895 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ALDH1A3P47895 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ALDH1A3P47895 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ALDH1A3P47895 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ALDH1A3P47895 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ALDH1A3P47895 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ALDH1A3P47895 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ALDH1A3P47895 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ALDH1A3P47895 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ALDH1A3P47895 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ALDH1A3P47895 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ALDH1A3P47895 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ALDH1A3P47895 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ALDH1A3P47895 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ALDH1A3P47895 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
ALDH1A3P47895 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ALDH1A3P47895 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ALDH1A3P47895 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ALDH1A3P47895 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
ALDH1A3P47895 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
ALDH1A3P47895 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ALDH1A3P47895 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ALDH1A3P47895 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ALDH1A3P47895 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
ALDH1A3P47895 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ALDH1A3P47895 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ALDH1A3P47895 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ALDH1A3P47895 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ALDH1A3P47895 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ALDH1A3P47895 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ALDH1A3P47895 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ALDH1A3P47895 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ALDH1A3P47895 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1576.9 ms