Protein–RNA interactions for Protein: P47869

GABRA2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA2P47869 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GABRA2P47869 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GABRA2P47869 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABRA2P47869 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABRA2P47869 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABRA2P47869 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABRA2P47869 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABRA2P47869 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABRA2P47869 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABRA2P47869 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABRA2P47869 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABRA2P47869 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABRA2P47869 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABRA2P47869 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABRA2P47869 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABRA2P47869 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABRA2P47869 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABRA2P47869 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABRA2P47869 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABRA2P47869 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABRA2P47869 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABRA2P47869 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABRA2P47869 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABRA2P47869 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABRA2P47869 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABRA2P47869 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GABRA2P47869 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABRA2P47869 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABRA2P47869 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GABRA2P47869 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABRA2P47869 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABRA2P47869 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABRA2P47869 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABRA2P47869 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABRA2P47869 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABRA2P47869 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABRA2P47869 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABRA2P47869 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GABRA2P47869 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABRA2P47869 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GABRA2P47869 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GABRA2P47869 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABRA2P47869 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABRA2P47869 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABRA2P47869 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABRA2P47869 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABRA2P47869 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABRA2P47869 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABRA2P47869 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABRA2P47869 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABRA2P47869 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABRA2P47869 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABRA2P47869 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABRA2P47869 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GABRA2P47869 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GABRA2P47869 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GABRA2P47869 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GABRA2P47869 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GABRA2P47869 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GABRA2P47869 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GABRA2P47869 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GABRA2P47869 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GABRA2P47869 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GABRA2P47869 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GABRA2P47869 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GABRA2P47869 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GABRA2P47869 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GABRA2P47869 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GABRA2P47869 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GABRA2P47869 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GABRA2P47869 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GABRA2P47869 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GABRA2P47869 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GABRA2P47869 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GABRA2P47869 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GABRA2P47869 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GABRA2P47869 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GABRA2P47869 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GABRA2P47869 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GABRA2P47869 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GABRA2P47869 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GABRA2P47869 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GABRA2P47869 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GABRA2P47869 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GABRA2P47869 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
GABRA2P47869 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GABRA2P47869 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GABRA2P47869 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GABRA2P47869 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
GABRA2P47869 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GABRA2P47869 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GABRA2P47869 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GABRA2P47869 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GABRA2P47869 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GABRA2P47869 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GABRA2P47869 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GABRA2P47869 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
GABRA2P47869 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GABRA2P47869 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GABRA2P47869 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.3 ms