Protein–RNA interactions for Protein: P46013

MKI67, Proliferation marker protein Ki-67, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKI67P46013 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MKI67P46013 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MKI67P46013 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MKI67P46013 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MKI67P46013 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MKI67P46013 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MKI67P46013 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MKI67P46013 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MKI67P46013 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MKI67P46013 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
MKI67P46013 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MKI67P46013 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MKI67P46013 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MKI67P46013 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MKI67P46013 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
MKI67P46013 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.92
MKI67P46013 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
MKI67P46013 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MKI67P46013 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27■■□□□ 1.91
MKI67P46013 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
MKI67P46013 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MKI67P46013 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MKI67P46013 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MKI67P46013 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MKI67P46013 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MKI67P46013 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MKI67P46013 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MKI67P46013 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MKI67P46013 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
MKI67P46013 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
MKI67P46013 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MKI67P46013 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MKI67P46013 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MKI67P46013 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
MKI67P46013 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
MKI67P46013 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MKI67P46013 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MKI67P46013 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
MKI67P46013 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MKI67P46013 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MKI67P46013 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MKI67P46013 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MKI67P46013 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
MKI67P46013 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MKI67P46013 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
MKI67P46013 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
MKI67P46013 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MKI67P46013 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MKI67P46013 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MKI67P46013 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MKI67P46013 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
MKI67P46013 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MKI67P46013 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MKI67P46013 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MKI67P46013 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MKI67P46013 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MKI67P46013 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MKI67P46013 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MKI67P46013 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MKI67P46013 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MKI67P46013 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MKI67P46013 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MKI67P46013 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
MKI67P46013 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MKI67P46013 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
MKI67P46013 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MKI67P46013 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MKI67P46013 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
MKI67P46013 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
MKI67P46013 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
MKI67P46013 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
MKI67P46013 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
MKI67P46013 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
MKI67P46013 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
MKI67P46013 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
MKI67P46013 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
MKI67P46013 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
MKI67P46013 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
MKI67P46013 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
MKI67P46013 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MKI67P46013 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MKI67P46013 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MKI67P46013 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MKI67P46013 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MKI67P46013 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MKI67P46013 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MKI67P46013 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MKI67P46013 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MKI67P46013 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
MKI67P46013 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MKI67P46013 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MKI67P46013 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MKI67P46013 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MKI67P46013 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MKI67P46013 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MKI67P46013 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MKI67P46013 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MKI67P46013 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MKI67P46013 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MKI67P46013 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms