Protein–RNA interactions for Protein: P41240

CSK, Tyrosine-protein kinase CSK, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSKP41240 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CSKP41240 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CSKP41240 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CSKP41240 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CSKP41240 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CSKP41240 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CSKP41240 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CSKP41240 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CSKP41240 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CSKP41240 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CSKP41240 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CSKP41240 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CSKP41240 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CSKP41240 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CSKP41240 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CSKP41240 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CSKP41240 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CSKP41240 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CSKP41240 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CSKP41240 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CSKP41240 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CSKP41240 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CSKP41240 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CSKP41240 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CSKP41240 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CSKP41240 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CSKP41240 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CSKP41240 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CSKP41240 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CSKP41240 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CSKP41240 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CSKP41240 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CSKP41240 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CSKP41240 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CSKP41240 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CSKP41240 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CSKP41240 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CSKP41240 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CSKP41240 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CSKP41240 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CSKP41240 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CSKP41240 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CSKP41240 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CSKP41240 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CSKP41240 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CSKP41240 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CSKP41240 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CSKP41240 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CSKP41240 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CSKP41240 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CSKP41240 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CSKP41240 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CSKP41240 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CSKP41240 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSKP41240 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSKP41240 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CSKP41240 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSKP41240 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CSKP41240 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSKP41240 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSKP41240 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CSKP41240 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CSKP41240 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CSKP41240 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CSKP41240 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CSKP41240 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CSKP41240 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CSKP41240 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CSKP41240 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CSKP41240 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CSKP41240 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CSKP41240 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CSKP41240 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CSKP41240 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CSKP41240 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CSKP41240 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CSKP41240 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CSKP41240 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CSKP41240 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CSKP41240 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CSKP41240 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CSKP41240 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CSKP41240 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CSKP41240 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CSKP41240 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CSKP41240 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CSKP41240 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CSKP41240 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CSKP41240 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CSKP41240 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CSKP41240 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSKP41240 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSKP41240 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CSKP41240 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSKP41240 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSKP41240 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSKP41240 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CSKP41240 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CSKP41240 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CSKP41240 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms