Protein–RNA interactions for Protein: P29084

GTF2E2, Transcription initiation factor IIE subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E2P29084 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF2E2P29084 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF2E2P29084 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF2E2P29084 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF2E2P29084 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF2E2P29084 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
GTF2E2P29084 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GTF2E2P29084 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GTF2E2P29084 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GTF2E2P29084 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GTF2E2P29084 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GTF2E2P29084 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GTF2E2P29084 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GTF2E2P29084 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GTF2E2P29084 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GTF2E2P29084 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF2E2P29084 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF2E2P29084 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF2E2P29084 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF2E2P29084 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF2E2P29084 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF2E2P29084 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF2E2P29084 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GTF2E2P29084 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GTF2E2P29084 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GTF2E2P29084 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GTF2E2P29084 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GTF2E2P29084 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GTF2E2P29084 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GTF2E2P29084 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GTF2E2P29084 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GTF2E2P29084 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GTF2E2P29084 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GTF2E2P29084 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GTF2E2P29084 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GTF2E2P29084 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GTF2E2P29084 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GTF2E2P29084 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GTF2E2P29084 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GTF2E2P29084 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GTF2E2P29084 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GTF2E2P29084 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GTF2E2P29084 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GTF2E2P29084 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GTF2E2P29084 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
GTF2E2P29084 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GTF2E2P29084 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GTF2E2P29084 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GTF2E2P29084 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GTF2E2P29084 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GTF2E2P29084 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GTF2E2P29084 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GTF2E2P29084 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GTF2E2P29084 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GTF2E2P29084 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GTF2E2P29084 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GTF2E2P29084 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
GTF2E2P29084 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GTF2E2P29084 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GTF2E2P29084 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GTF2E2P29084 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GTF2E2P29084 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
GTF2E2P29084 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GTF2E2P29084 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GTF2E2P29084 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GTF2E2P29084 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GTF2E2P29084 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GTF2E2P29084 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GTF2E2P29084 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GTF2E2P29084 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GTF2E2P29084 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GTF2E2P29084 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GTF2E2P29084 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GTF2E2P29084 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GTF2E2P29084 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GTF2E2P29084 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF2E2P29084 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF2E2P29084 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF2E2P29084 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF2E2P29084 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF2E2P29084 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF2E2P29084 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF2E2P29084 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF2E2P29084 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF2E2P29084 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF2E2P29084 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF2E2P29084 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF2E2P29084 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF2E2P29084 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF2E2P29084 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF2E2P29084 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF2E2P29084 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF2E2P29084 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF2E2P29084 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF2E2P29084 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF2E2P29084 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF2E2P29084 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF2E2P29084 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF2E2P29084 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF2E2P29084 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.8 ms