Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
GCAP28676 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
GCAP28676 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GCAP28676 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GCAP28676 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GCAP28676 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GCAP28676 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GCAP28676 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GCAP28676 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GCAP28676 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GCAP28676 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GCAP28676 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GCAP28676 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GCAP28676 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GCAP28676 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GCAP28676 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GCAP28676 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GCAP28676 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GCAP28676 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
GCAP28676 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
GCAP28676 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24■■□□□ 1.43
GCAP28676 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GCAP28676 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GCAP28676 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GCAP28676 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GCAP28676 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GCAP28676 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GCAP28676 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GCAP28676 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GCAP28676 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GCAP28676 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GCAP28676 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GCAP28676 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GCAP28676 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GCAP28676 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GCAP28676 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GCAP28676 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GCAP28676 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GCAP28676 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GCAP28676 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GCAP28676 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GCAP28676 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GCAP28676 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GCAP28676 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GCAP28676 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GCAP28676 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GCAP28676 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GCAP28676 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GCAP28676 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GCAP28676 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GCAP28676 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
GCAP28676 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
GCAP28676 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GCAP28676 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GCAP28676 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GCAP28676 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GCAP28676 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GCAP28676 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GCAP28676 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GCAP28676 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GCAP28676 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GCAP28676 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GCAP28676 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GCAP28676 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GCAP28676 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GCAP28676 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GCAP28676 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GCAP28676 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GCAP28676 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GCAP28676 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GCAP28676 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GCAP28676 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GCAP28676 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GCAP28676 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GCAP28676 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GCAP28676 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GCAP28676 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GCAP28676 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GCAP28676 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GCAP28676 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GCAP28676 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GCAP28676 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GCAP28676 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GCAP28676 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GCAP28676 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GCAP28676 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GCAP28676 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GCAP28676 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GCAP28676 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GCAP28676 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GCAP28676 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GCAP28676 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GCAP28676 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GCAP28676 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GCAP28676 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GCAP28676 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GCAP28676 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GCAP28676 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
GCAP28676 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GCAP28676 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.6 ms