Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DUSP1P28562 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DUSP1P28562 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DUSP1P28562 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DUSP1P28562 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DUSP1P28562 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
DUSP1P28562 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DUSP1P28562 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DUSP1P28562 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DUSP1P28562 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DUSP1P28562 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DUSP1P28562 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DUSP1P28562 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DUSP1P28562 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DUSP1P28562 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DUSP1P28562 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DUSP1P28562 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DUSP1P28562 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
DUSP1P28562 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
DUSP1P28562 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DUSP1P28562 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DUSP1P28562 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DUSP1P28562 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DUSP1P28562 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DUSP1P28562 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DUSP1P28562 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DUSP1P28562 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DUSP1P28562 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DUSP1P28562 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DUSP1P28562 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
DUSP1P28562 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DUSP1P28562 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DUSP1P28562 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DUSP1P28562 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DUSP1P28562 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DUSP1P28562 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DUSP1P28562 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DUSP1P28562 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DUSP1P28562 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DUSP1P28562 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DUSP1P28562 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DUSP1P28562 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DUSP1P28562 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DUSP1P28562 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DUSP1P28562 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DUSP1P28562 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DUSP1P28562 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DUSP1P28562 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DUSP1P28562 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DUSP1P28562 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DUSP1P28562 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DUSP1P28562 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DUSP1P28562 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DUSP1P28562 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
DUSP1P28562 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DUSP1P28562 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DUSP1P28562 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DUSP1P28562 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DUSP1P28562 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DUSP1P28562 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DUSP1P28562 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DUSP1P28562 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DUSP1P28562 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DUSP1P28562 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DUSP1P28562 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DUSP1P28562 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
DUSP1P28562 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DUSP1P28562 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DUSP1P28562 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DUSP1P28562 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DUSP1P28562 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DUSP1P28562 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DUSP1P28562 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DUSP1P28562 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DUSP1P28562 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
DUSP1P28562 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DUSP1P28562 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DUSP1P28562 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DUSP1P28562 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DUSP1P28562 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DUSP1P28562 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DUSP1P28562 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DUSP1P28562 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DUSP1P28562 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
DUSP1P28562 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DUSP1P28562 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DUSP1P28562 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DUSP1P28562 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DUSP1P28562 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DUSP1P28562 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
DUSP1P28562 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DUSP1P28562 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DUSP1P28562 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DUSP1P28562 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
DUSP1P28562 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
DUSP1P28562 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DUSP1P28562 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DUSP1P28562 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DUSP1P28562 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DUSP1P28562 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1168.5 ms