Protein–RNA interactions for Protein: P27695

APEX1, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX1P27695 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
APEX1P27695 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APEX1P27695 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
APEX1P27695 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
APEX1P27695 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
APEX1P27695 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
APEX1P27695 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
APEX1P27695 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
APEX1P27695 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
APEX1P27695 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
APEX1P27695 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
APEX1P27695 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APEX1P27695 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APEX1P27695 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APEX1P27695 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APEX1P27695 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
APEX1P27695 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APEX1P27695 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APEX1P27695 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
APEX1P27695 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
APEX1P27695 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APEX1P27695 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APEX1P27695 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APEX1P27695 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APEX1P27695 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
APEX1P27695 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APEX1P27695 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APEX1P27695 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APEX1P27695 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APEX1P27695 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
APEX1P27695 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
APEX1P27695 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
APEX1P27695 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APEX1P27695 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
APEX1P27695 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
APEX1P27695 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
APEX1P27695 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
APEX1P27695 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
APEX1P27695 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APEX1P27695 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APEX1P27695 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APEX1P27695 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APEX1P27695 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
APEX1P27695 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
APEX1P27695 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APEX1P27695 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APEX1P27695 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
APEX1P27695 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APEX1P27695 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APEX1P27695 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APEX1P27695 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APEX1P27695 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
APEX1P27695 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
APEX1P27695 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
APEX1P27695 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
APEX1P27695 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
APEX1P27695 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
APEX1P27695 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
APEX1P27695 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
APEX1P27695 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
APEX1P27695 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
APEX1P27695 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
APEX1P27695 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
APEX1P27695 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
APEX1P27695 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
APEX1P27695 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
APEX1P27695 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
APEX1P27695 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
APEX1P27695 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
APEX1P27695 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
APEX1P27695 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
APEX1P27695 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.32■■□□□ 1
APEX1P27695 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
APEX1P27695 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
APEX1P27695 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
APEX1P27695 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
APEX1P27695 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
APEX1P27695 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
APEX1P27695 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
APEX1P27695 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
APEX1P27695 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
APEX1P27695 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
APEX1P27695 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
APEX1P27695 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
APEX1P27695 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
APEX1P27695 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
APEX1P27695 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
APEX1P27695 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
APEX1P27695 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
APEX1P27695 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
APEX1P27695 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
APEX1P27695 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
APEX1P27695 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
APEX1P27695 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
APEX1P27695 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
APEX1P27695 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.3■■□□□ 1
APEX1P27695 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
APEX1P27695 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
APEX1P27695 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
APEX1P27695 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms