Protein–RNA interactions for Protein: P20941

PDC, Phosducin, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCP20941 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PDCP20941 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PDCP20941 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PDCP20941 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PDCP20941 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PDCP20941 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PDCP20941 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PDCP20941 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PDCP20941 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
PDCP20941 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PDCP20941 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PDCP20941 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PDCP20941 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
PDCP20941 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PDCP20941 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PDCP20941 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PDCP20941 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PDCP20941 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PDCP20941 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PDCP20941 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PDCP20941 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
PDCP20941 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PDCP20941 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PDCP20941 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PDCP20941 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PDCP20941 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PDCP20941 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PDCP20941 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PDCP20941 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PDCP20941 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PDCP20941 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PDCP20941 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PDCP20941 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PDCP20941 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
PDCP20941 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PDCP20941 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
PDCP20941 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PDCP20941 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PDCP20941 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PDCP20941 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PDCP20941 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PDCP20941 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PDCP20941 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PDCP20941 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PDCP20941 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PDCP20941 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
PDCP20941 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PDCP20941 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PDCP20941 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PDCP20941 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PDCP20941 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PDCP20941 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PDCP20941 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PDCP20941 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PDCP20941 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PDCP20941 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PDCP20941 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PDCP20941 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PDCP20941 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PDCP20941 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PDCP20941 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
PDCP20941 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PDCP20941 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PDCP20941 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PDCP20941 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PDCP20941 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PDCP20941 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PDCP20941 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PDCP20941 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PDCP20941 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PDCP20941 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PDCP20941 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PDCP20941 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PDCP20941 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PDCP20941 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PDCP20941 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PDCP20941 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PDCP20941 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PDCP20941 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PDCP20941 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PDCP20941 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PDCP20941 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PDCP20941 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PDCP20941 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
PDCP20941 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
PDCP20941 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PDCP20941 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PDCP20941 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PDCP20941 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PDCP20941 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PDCP20941 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
PDCP20941 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PDCP20941 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PDCP20941 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PDCP20941 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PDCP20941 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PDCP20941 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PDCP20941 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PDCP20941 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PDCP20941 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 156.8 ms