Protein–RNA interactions for Protein: P20132

SDS, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDSP20132 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SDSP20132 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SDSP20132 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SDSP20132 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
SDSP20132 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
SDSP20132 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
SDSP20132 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
SDSP20132 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SDSP20132 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SDSP20132 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SDSP20132 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SDSP20132 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SDSP20132 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
SDSP20132 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SDSP20132 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SDSP20132 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SDSP20132 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SDSP20132 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SDSP20132 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SDSP20132 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SDSP20132 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SDSP20132 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SDSP20132 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SDSP20132 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SDSP20132 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SDSP20132 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SDSP20132 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SDSP20132 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SDSP20132 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SDSP20132 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SDSP20132 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
SDSP20132 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SDSP20132 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SDSP20132 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SDSP20132 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SDSP20132 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SDSP20132 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SDSP20132 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
SDSP20132 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
SDSP20132 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SDSP20132 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SDSP20132 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SDSP20132 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SDSP20132 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SDSP20132 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SDSP20132 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SDSP20132 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SDSP20132 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SDSP20132 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SDSP20132 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SDSP20132 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SDSP20132 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SDSP20132 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SDSP20132 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SDSP20132 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SDSP20132 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SDSP20132 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SDSP20132 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SDSP20132 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SDSP20132 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SDSP20132 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SDSP20132 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SDSP20132 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SDSP20132 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SDSP20132 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SDSP20132 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
SDSP20132 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SDSP20132 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SDSP20132 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SDSP20132 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SDSP20132 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SDSP20132 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SDSP20132 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SDSP20132 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SDSP20132 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SDSP20132 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SDSP20132 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SDSP20132 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SDSP20132 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SDSP20132 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SDSP20132 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SDSP20132 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SDSP20132 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SDSP20132 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SDSP20132 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SDSP20132 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SDSP20132 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SDSP20132 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SDSP20132 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SDSP20132 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SDSP20132 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SDSP20132 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SDSP20132 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SDSP20132 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SDSP20132 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SDSP20132 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SDSP20132 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SDSP20132 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SDSP20132 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SDSP20132 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms