Protein–RNA interactions for Protein: P19388

POLR2E, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2EP19388 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLR2EP19388 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
POLR2EP19388 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLR2EP19388 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLR2EP19388 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLR2EP19388 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLR2EP19388 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLR2EP19388 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLR2EP19388 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
POLR2EP19388 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
POLR2EP19388 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
POLR2EP19388 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLR2EP19388 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLR2EP19388 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLR2EP19388 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLR2EP19388 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLR2EP19388 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLR2EP19388 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLR2EP19388 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLR2EP19388 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLR2EP19388 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLR2EP19388 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
POLR2EP19388 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLR2EP19388 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLR2EP19388 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLR2EP19388 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLR2EP19388 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLR2EP19388 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLR2EP19388 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLR2EP19388 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLR2EP19388 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLR2EP19388 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLR2EP19388 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLR2EP19388 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLR2EP19388 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLR2EP19388 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLR2EP19388 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLR2EP19388 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLR2EP19388 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR2EP19388 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR2EP19388 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR2EP19388 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR2EP19388 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR2EP19388 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLR2EP19388 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLR2EP19388 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLR2EP19388 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
POLR2EP19388 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR2EP19388 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR2EP19388 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR2EP19388 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR2EP19388 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR2EP19388 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR2EP19388 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR2EP19388 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLR2EP19388 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLR2EP19388 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLR2EP19388 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLR2EP19388 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLR2EP19388 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLR2EP19388 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR2EP19388 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR2EP19388 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR2EP19388 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR2EP19388 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR2EP19388 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR2EP19388 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR2EP19388 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR2EP19388 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR2EP19388 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR2EP19388 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR2EP19388 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
POLR2EP19388 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLR2EP19388 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLR2EP19388 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLR2EP19388 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLR2EP19388 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLR2EP19388 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLR2EP19388 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLR2EP19388 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR2EP19388 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR2EP19388 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR2EP19388 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR2EP19388 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR2EP19388 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR2EP19388 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR2EP19388 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR2EP19388 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR2EP19388 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR2EP19388 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR2EP19388 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR2EP19388 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR2EP19388 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR2EP19388 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR2EP19388 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR2EP19388 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR2EP19388 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR2EP19388 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR2EP19388 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLR2EP19388 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms