Protein–RNA interactions for Protein: P18621

RPL17, 60S ribosomal protein L17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL17P18621 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RPL17P18621 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RPL17P18621 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RPL17P18621 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RPL17P18621 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RPL17P18621 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RPL17P18621 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RPL17P18621 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RPL17P18621 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
RPL17P18621 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RPL17P18621 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RPL17P18621 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
RPL17P18621 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RPL17P18621 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RPL17P18621 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RPL17P18621 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RPL17P18621 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RPL17P18621 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
RPL17P18621 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RPL17P18621 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
RPL17P18621 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
RPL17P18621 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RPL17P18621 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RPL17P18621 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RPL17P18621 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RPL17P18621 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RPL17P18621 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
RPL17P18621 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RPL17P18621 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RPL17P18621 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RPL17P18621 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RPL17P18621 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RPL17P18621 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RPL17P18621 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RPL17P18621 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RPL17P18621 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RPL17P18621 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RPL17P18621 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RPL17P18621 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RPL17P18621 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RPL17P18621 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RPL17P18621 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RPL17P18621 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RPL17P18621 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RPL17P18621 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RPL17P18621 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RPL17P18621 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RPL17P18621 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RPL17P18621 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RPL17P18621 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RPL17P18621 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RPL17P18621 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RPL17P18621 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPL17P18621 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPL17P18621 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPL17P18621 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPL17P18621 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPL17P18621 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPL17P18621 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
RPL17P18621 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPL17P18621 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPL17P18621 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RPL17P18621 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RPL17P18621 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RPL17P18621 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RPL17P18621 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RPL17P18621 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPL17P18621 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPL17P18621 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPL17P18621 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPL17P18621 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPL17P18621 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPL17P18621 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPL17P18621 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPL17P18621 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPL17P18621 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPL17P18621 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPL17P18621 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPL17P18621 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPL17P18621 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPL17P18621 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPL17P18621 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RPL17P18621 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RPL17P18621 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RPL17P18621 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RPL17P18621 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
RPL17P18621 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RPL17P18621 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RPL17P18621 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RPL17P18621 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
RPL17P18621 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
RPL17P18621 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
RPL17P18621 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPL17P18621 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPL17P18621 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPL17P18621 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPL17P18621 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPL17P18621 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPL17P18621 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPL17P18621 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 188.2 ms