Protein–RNA interactions for Protein: P18085

ARF4, ADP-ribosylation factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF4P18085 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ARF4P18085 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ARF4P18085 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ARF4P18085 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ARF4P18085 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ARF4P18085 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ARF4P18085 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ARF4P18085 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ARF4P18085 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
ARF4P18085 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ARF4P18085 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ARF4P18085 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ARF4P18085 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ARF4P18085 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
ARF4P18085 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ARF4P18085 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ARF4P18085 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ARF4P18085 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
ARF4P18085 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
ARF4P18085 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ARF4P18085 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ARF4P18085 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ARF4P18085 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ARF4P18085 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ARF4P18085 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ARF4P18085 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ARF4P18085 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ARF4P18085 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
ARF4P18085 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ARF4P18085 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ARF4P18085 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ARF4P18085 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ARF4P18085 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ARF4P18085 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ARF4P18085 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ARF4P18085 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ARF4P18085 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
ARF4P18085 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ARF4P18085 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ARF4P18085 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ARF4P18085 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ARF4P18085 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ARF4P18085 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
ARF4P18085 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ARF4P18085 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ARF4P18085 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ARF4P18085 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ARF4P18085 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ARF4P18085 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ARF4P18085 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ARF4P18085 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ARF4P18085 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ARF4P18085 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ARF4P18085 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ARF4P18085 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ARF4P18085 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ARF4P18085 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ARF4P18085 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ARF4P18085 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ARF4P18085 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ARF4P18085 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
ARF4P18085 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
ARF4P18085 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ARF4P18085 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ARF4P18085 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ARF4P18085 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ARF4P18085 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ARF4P18085 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ARF4P18085 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ARF4P18085 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ARF4P18085 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ARF4P18085 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ARF4P18085 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ARF4P18085 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ARF4P18085 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ARF4P18085 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ARF4P18085 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ARF4P18085 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ARF4P18085 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ARF4P18085 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ARF4P18085 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ARF4P18085 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ARF4P18085 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ARF4P18085 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ARF4P18085 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ARF4P18085 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ARF4P18085 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ARF4P18085 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ARF4P18085 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ARF4P18085 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ARF4P18085 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ARF4P18085 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
ARF4P18085 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ARF4P18085 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ARF4P18085 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
ARF4P18085 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ARF4P18085 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26■■□□□ 1.75
ARF4P18085 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26■■□□□ 1.75
ARF4P18085 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ARF4P18085 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms