Protein–RNA interactions for Protein: P15336

ATF2, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-2, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF2P15336 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATF2P15336 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATF2P15336 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATF2P15336 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATF2P15336 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATF2P15336 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATF2P15336 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATF2P15336 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATF2P15336 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATF2P15336 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATF2P15336 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATF2P15336 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATF2P15336 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATF2P15336 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATF2P15336 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATF2P15336 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATF2P15336 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATF2P15336 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATF2P15336 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
ATF2P15336 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATF2P15336 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATF2P15336 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATF2P15336 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATF2P15336 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATF2P15336 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATF2P15336 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATF2P15336 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
ATF2P15336 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATF2P15336 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATF2P15336 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATF2P15336 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATF2P15336 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATF2P15336 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATF2P15336 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATF2P15336 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATF2P15336 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATF2P15336 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATF2P15336 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATF2P15336 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATF2P15336 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATF2P15336 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATF2P15336 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATF2P15336 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATF2P15336 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATF2P15336 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATF2P15336 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATF2P15336 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATF2P15336 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
ATF2P15336 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ATF2P15336 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ATF2P15336 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATF2P15336 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
ATF2P15336 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATF2P15336 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATF2P15336 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATF2P15336 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATF2P15336 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATF2P15336 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATF2P15336 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATF2P15336 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATF2P15336 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATF2P15336 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATF2P15336 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATF2P15336 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATF2P15336 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATF2P15336 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
ATF2P15336 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
ATF2P15336 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATF2P15336 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATF2P15336 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATF2P15336 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATF2P15336 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATF2P15336 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
ATF2P15336 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATF2P15336 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATF2P15336 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATF2P15336 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATF2P15336 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATF2P15336 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATF2P15336 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATF2P15336 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATF2P15336 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATF2P15336 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATF2P15336 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATF2P15336 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATF2P15336 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
ATF2P15336 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATF2P15336 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATF2P15336 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATF2P15336 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATF2P15336 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATF2P15336 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATF2P15336 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATF2P15336 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATF2P15336 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATF2P15336 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATF2P15336 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATF2P15336 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
ATF2P15336 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATF2P15336 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123 ms