Protein–RNA interactions for Protein: P13645

KRT10, Keratin, type I cytoskeletal 10, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT10P13645 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT10P13645 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT10P13645 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT10P13645 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT10P13645 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT10P13645 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
KRT10P13645 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
KRT10P13645 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT10P13645 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT10P13645 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT10P13645 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT10P13645 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT10P13645 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT10P13645 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT10P13645 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT10P13645 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT10P13645 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT10P13645 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT10P13645 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT10P13645 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT10P13645 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT10P13645 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT10P13645 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT10P13645 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT10P13645 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT10P13645 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT10P13645 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT10P13645 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT10P13645 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT10P13645 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT10P13645 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT10P13645 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT10P13645 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT10P13645 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT10P13645 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT10P13645 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT10P13645 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT10P13645 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT10P13645 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT10P13645 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT10P13645 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT10P13645 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT10P13645 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT10P13645 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
KRT10P13645 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT10P13645 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT10P13645 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT10P13645 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT10P13645 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT10P13645 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT10P13645 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT10P13645 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT10P13645 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT10P13645 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT10P13645 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT10P13645 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT10P13645 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT10P13645 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT10P13645 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT10P13645 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT10P13645 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT10P13645 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT10P13645 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT10P13645 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT10P13645 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT10P13645 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT10P13645 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT10P13645 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT10P13645 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT10P13645 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT10P13645 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT10P13645 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT10P13645 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT10P13645 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT10P13645 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT10P13645 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT10P13645 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT10P13645 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT10P13645 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT10P13645 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT10P13645 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT10P13645 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT10P13645 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT10P13645 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT10P13645 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT10P13645 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT10P13645 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT10P13645 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT10P13645 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT10P13645 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT10P13645 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT10P13645 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT10P13645 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT10P13645 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT10P13645 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT10P13645 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT10P13645 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT10P13645 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT10P13645 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT10P13645 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.7 ms