Protein–RNA interactions for Protein: P13500

CCL2, C-C motif chemokine 2, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL2P13500 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCL2P13500 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCL2P13500 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCL2P13500 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CCL2P13500 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCL2P13500 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCL2P13500 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCL2P13500 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCL2P13500 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCL2P13500 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCL2P13500 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCL2P13500 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCL2P13500 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCL2P13500 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCL2P13500 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCL2P13500 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CCL2P13500 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CCL2P13500 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CCL2P13500 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCL2P13500 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCL2P13500 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCL2P13500 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCL2P13500 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCL2P13500 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCL2P13500 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCL2P13500 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCL2P13500 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CCL2P13500 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCL2P13500 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCL2P13500 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCL2P13500 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCL2P13500 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCL2P13500 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CCL2P13500 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCL2P13500 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCL2P13500 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCL2P13500 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CCL2P13500 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCL2P13500 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCL2P13500 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCL2P13500 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCL2P13500 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCL2P13500 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCL2P13500 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCL2P13500 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCL2P13500 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCL2P13500 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCL2P13500 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCL2P13500 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCL2P13500 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCL2P13500 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCL2P13500 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCL2P13500 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCL2P13500 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCL2P13500 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCL2P13500 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCL2P13500 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCL2P13500 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCL2P13500 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCL2P13500 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCL2P13500 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCL2P13500 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCL2P13500 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCL2P13500 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCL2P13500 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCL2P13500 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCL2P13500 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CCL2P13500 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCL2P13500 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCL2P13500 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCL2P13500 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCL2P13500 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCL2P13500 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCL2P13500 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCL2P13500 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
CCL2P13500 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCL2P13500 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCL2P13500 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCL2P13500 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCL2P13500 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCL2P13500 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCL2P13500 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCL2P13500 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCL2P13500 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCL2P13500 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCL2P13500 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCL2P13500 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCL2P13500 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCL2P13500 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCL2P13500 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCL2P13500 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
CCL2P13500 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCL2P13500 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCL2P13500 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCL2P13500 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCL2P13500 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCL2P13500 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCL2P13500 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCL2P13500 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCL2P13500 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms