Protein–RNA interactions for Protein: P04280

PRB1, Basic salivary proline-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRB1P04280 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRB1P04280 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRB1P04280 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRB1P04280 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRB1P04280 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRB1P04280 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRB1P04280 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PRB1P04280 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PRB1P04280 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRB1P04280 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PRB1P04280 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRB1P04280 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRB1P04280 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRB1P04280 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRB1P04280 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRB1P04280 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRB1P04280 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRB1P04280 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRB1P04280 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRB1P04280 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRB1P04280 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRB1P04280 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRB1P04280 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRB1P04280 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRB1P04280 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRB1P04280 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRB1P04280 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PRB1P04280 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRB1P04280 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRB1P04280 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRB1P04280 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRB1P04280 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRB1P04280 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRB1P04280 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PRB1P04280 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRB1P04280 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRB1P04280 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRB1P04280 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PRB1P04280 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRB1P04280 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRB1P04280 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRB1P04280 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRB1P04280 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRB1P04280 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRB1P04280 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRB1P04280 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRB1P04280 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRB1P04280 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRB1P04280 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRB1P04280 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRB1P04280 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRB1P04280 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRB1P04280 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRB1P04280 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRB1P04280 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRB1P04280 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRB1P04280 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRB1P04280 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PRB1P04280 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRB1P04280 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRB1P04280 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRB1P04280 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRB1P04280 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRB1P04280 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRB1P04280 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRB1P04280 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRB1P04280 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRB1P04280 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRB1P04280 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRB1P04280 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PRB1P04280 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRB1P04280 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRB1P04280 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRB1P04280 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRB1P04280 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRB1P04280 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRB1P04280 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRB1P04280 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRB1P04280 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRB1P04280 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRB1P04280 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PRB1P04280 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PRB1P04280 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PRB1P04280 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRB1P04280 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRB1P04280 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRB1P04280 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRB1P04280 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PRB1P04280 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRB1P04280 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRB1P04280 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRB1P04280 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRB1P04280 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PRB1P04280 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PRB1P04280 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRB1P04280 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRB1P04280 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRB1P04280 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRB1P04280 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRB1P04280 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.1 ms