Protein–RNA interactions for Protein: P01282

VIP, VIP peptides, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIPP01282 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
VIPP01282 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VIPP01282 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VIPP01282 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
VIPP01282 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VIPP01282 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VIPP01282 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VIPP01282 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VIPP01282 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VIPP01282 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VIPP01282 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VIPP01282 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VIPP01282 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VIPP01282 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VIPP01282 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VIPP01282 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VIPP01282 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VIPP01282 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VIPP01282 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VIPP01282 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VIPP01282 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VIPP01282 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VIPP01282 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VIPP01282 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VIPP01282 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VIPP01282 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VIPP01282 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VIPP01282 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VIPP01282 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VIPP01282 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VIPP01282 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VIPP01282 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VIPP01282 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VIPP01282 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VIPP01282 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VIPP01282 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VIPP01282 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VIPP01282 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VIPP01282 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VIPP01282 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VIPP01282 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VIPP01282 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VIPP01282 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
VIPP01282 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VIPP01282 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VIPP01282 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VIPP01282 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VIPP01282 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VIPP01282 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VIPP01282 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
VIPP01282 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VIPP01282 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VIPP01282 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
VIPP01282 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VIPP01282 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VIPP01282 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VIPP01282 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
VIPP01282 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VIPP01282 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
VIPP01282 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VIPP01282 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VIPP01282 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VIPP01282 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VIPP01282 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VIPP01282 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VIPP01282 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VIPP01282 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VIPP01282 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VIPP01282 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VIPP01282 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VIPP01282 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VIPP01282 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VIPP01282 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VIPP01282 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VIPP01282 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VIPP01282 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VIPP01282 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VIPP01282 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VIPP01282 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VIPP01282 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VIPP01282 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VIPP01282 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VIPP01282 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VIPP01282 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VIPP01282 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VIPP01282 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VIPP01282 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VIPP01282 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VIPP01282 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VIPP01282 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VIPP01282 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VIPP01282 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VIPP01282 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VIPP01282 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VIPP01282 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VIPP01282 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VIPP01282 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VIPP01282 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
VIPP01282 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VIPP01282 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.5 ms