Protein–RNA interactions for Protein: O96020

CCNE2, G1/S-specific cyclin-E2, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNE2O96020 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCNE2O96020 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCNE2O96020 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCNE2O96020 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CCNE2O96020 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCNE2O96020 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCNE2O96020 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCNE2O96020 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCNE2O96020 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCNE2O96020 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCNE2O96020 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCNE2O96020 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCNE2O96020 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCNE2O96020 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCNE2O96020 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCNE2O96020 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCNE2O96020 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCNE2O96020 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCNE2O96020 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCNE2O96020 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCNE2O96020 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCNE2O96020 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCNE2O96020 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCNE2O96020 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCNE2O96020 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCNE2O96020 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCNE2O96020 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CCNE2O96020 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCNE2O96020 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCNE2O96020 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCNE2O96020 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCNE2O96020 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCNE2O96020 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCNE2O96020 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCNE2O96020 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCNE2O96020 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCNE2O96020 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCNE2O96020 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCNE2O96020 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CCNE2O96020 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCNE2O96020 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCNE2O96020 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCNE2O96020 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCNE2O96020 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CCNE2O96020 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCNE2O96020 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCNE2O96020 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCNE2O96020 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCNE2O96020 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCNE2O96020 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCNE2O96020 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCNE2O96020 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCNE2O96020 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCNE2O96020 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCNE2O96020 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCNE2O96020 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCNE2O96020 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCNE2O96020 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCNE2O96020 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCNE2O96020 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCNE2O96020 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCNE2O96020 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCNE2O96020 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCNE2O96020 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCNE2O96020 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCNE2O96020 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCNE2O96020 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCNE2O96020 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCNE2O96020 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCNE2O96020 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCNE2O96020 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCNE2O96020 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCNE2O96020 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCNE2O96020 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCNE2O96020 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCNE2O96020 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCNE2O96020 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CCNE2O96020 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CCNE2O96020 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.76■■□□□ 1.88
CCNE2O96020 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
CCNE2O96020 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCNE2O96020 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCNE2O96020 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCNE2O96020 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCNE2O96020 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCNE2O96020 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCNE2O96020 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCNE2O96020 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCNE2O96020 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCNE2O96020 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CCNE2O96020 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCNE2O96020 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCNE2O96020 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCNE2O96020 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCNE2O96020 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCNE2O96020 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCNE2O96020 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCNE2O96020 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCNE2O96020 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCNE2O96020 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.8 ms